More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0511 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  64.3 
 
 		 680 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  64.79 
 
 		 814 aa  795    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  65.96 
 
 		 695 aa  796    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 726 aa  1443    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  39.65 
 
 		 819 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  39.19 
 
 		 892 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  38.34 
 
 		 830 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 818 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  37.99 
 
 		 773 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  36.94 
 
 		 880 aa  363  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 840 aa  363  6e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  38.45 
 
 		 758 aa  362  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  39.63 
 
 		 758 aa  362  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 		 817 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.53 
 
 		 720 aa  357  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 		 807 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  39.12 
 
 		 820 aa  351  3e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 		 801 aa  349  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  37.26 
 
 		 871 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 808 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  37.57 
 
 		 693 aa  343  7e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 816 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  35.56 
 
 		 810 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  34.64 
 
 		 801 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  39.75 
 
 		 1057 aa  338  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 816 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.67 
 
 		 737 aa  334  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 		 766 aa  334  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 816 aa  334  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 816 aa  334  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  35.83 
 
 		 721 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.61 
 
 		 747 aa  332  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  33.84 
 
 		 833 aa  332  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.68 
 
 		 821 aa  331  3e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 		 877 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 824 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 		 830 aa  328  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 		 831 aa  324  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 		 831 aa  324  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  35.81 
 
 		 739 aa  323  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 828 aa  323  6e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 		 705 aa  319  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  34.32 
 
 		 784 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  34.53 
 
 		 740 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  34.11 
 
 		 727 aa  314  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.06 
 
 		 744 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 		 759 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  34.93 
 
 		 807 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.38 
 
 		 763 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  34.3 
 
 		 772 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 		 766 aa  303  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  34.41 
 
 		 821 aa  299  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  33.62 
 
 		 789 aa  299  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 		 736 aa  299  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 710 aa  297  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 710 aa  294  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 		 761 aa  293  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  36.15 
 
 		 710 aa  292  1e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  32.7 
 
 		 750 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  34.2 
 
 		 765 aa  289  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  34.12 
 
 		 838 aa  289  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 723 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 		 703 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  36.2 
 
 		 722 aa  280  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  36.98 
 
 		 700 aa  278  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  34.26 
 
 		 761 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 		 723 aa  273  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.71 
 
 		 817 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.43 
 
 		 727 aa  269  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.32 
 
 		 648 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  33.13 
 
 		 768 aa  258  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  34.15 
 
 		 726 aa  257  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  32.35 
 
 		 661 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.3 
 
 		 710 aa  254  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.39 
 
 		 811 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  32.6 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  34.31 
 
 		 714 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  32.67 
 
 		 732 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  30.47 
 
 		 771 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  31.29 
 
 		 776 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.39 
 
 		 734 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.71 
 
 		 643 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.28 
 
 		 751 aa  242  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.68 
 
 		 728 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  33.73 
 
 		 728 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  33.19 
 
 		 727 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 		 727 aa  237  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  31.32 
 
 		 704 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  33.88 
 
 		 739 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  32.26 
 
 		 658 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  30.4 
 
 		 773 aa  233  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  33.13 
 
 		 712 aa  232  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  32.92 
 
 		 735 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 764 aa  231  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  32.15 
 
 		 734 aa  231  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.02 
 
 		 643 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.02 
 
 		 643 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.04 
 
 		 720 aa  230  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  30.9 
 
 		 761 aa  230  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34 
 
 		 714 aa  230  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>