More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3052 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  100 
 
 		 772 aa  1583    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.92 
 
 		 379 aa  127  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.06 
 
 		 387 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.05 
 
 		 476 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  39.15 
 
 		 420 aa  117  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  41.98 
 
 		 385 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  41.88 
 
 		 418 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  41.88 
 
 		 397 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.26 
 
 		 485 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  40.1 
 
 		 391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  40.59 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1370  hypothetical protein  46.51 
 
 		 139 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000915569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 415 aa  111  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  43.12 
 
 		 372 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  42.5 
 
 		 411 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  43.12 
 
 		 402 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  35.35 
 
 		 508 aa  110  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  43.12 
 
 		 402 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  39.18 
 
 		 401 aa  110  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.91 
 
 		 410 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0872  putative lipoprotein  60 
 
 		 155 aa  109  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  35.35 
 
 		 476 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  41.76 
 
 		 466 aa  109  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1172  putative lipoprotein  56.63 
 
 		 145 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000330219  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.59 
 
 		 464 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  38.98 
 
 		 394 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0898  hypothetical protein  60.76 
 
 		 135 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.98 
 
 		 401 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 		 415 aa  107  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  40.59 
 
 		 402 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  38.74 
 
 		 415 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  41.14 
 
 		 500 aa  106  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  41.28 
 
 		 529 aa  106  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3363  hypothetical protein  59.49 
 
 		 135 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.486225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 649 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  36 
 
 		 264 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  38.82 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.82 
 
 		 483 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  35.32 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  44.05 
 
 		 504 aa  105  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  33.8 
 
 		 464 aa  105  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  39.18 
 
 		 396 aa  104  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  40.99 
 
 		 408 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  39.57 
 
 		 397 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.99 
 
 		 408 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  39.57 
 
 		 383 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  40.35 
 
 		 458 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  44.91 
 
 		 502 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.6 
 
 		 405 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  39.02 
 
 		 450 aa  103  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  42.07 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  34.36 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  40.35 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  40 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  35.44 
 
 		 487 aa  103  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  38.54 
 
 		 450 aa  103  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  40.68 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  39.33 
 
 		 537 aa  103  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  35.75 
 
 		 483 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  34.57 
 
 		 348 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  34.68 
 
 		 522 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  40.35 
 
 		 459 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  43.02 
 
 		 451 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  38.12 
 
 		 406 aa  102  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  41.52 
 
 		 509 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  34.55 
 
 		 482 aa  102  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  42.69 
 
 		 503 aa  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  38.05 
 
 		 450 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  42.69 
 
 		 503 aa  101  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  41.52 
 
 		 496 aa  101  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 428 aa  101  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  41.51 
 
 		 462 aa  101  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  33.91 
 
 		 523 aa  101  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  33.5 
 
 		 475 aa  101  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  42.35 
 
 		 496 aa  101  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  36.24 
 
 		 523 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  29.51 
 
 		 514 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.41 
 
 		 355 aa  100  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.85 
 
 		 464 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  42.35 
 
 		 496 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  29.73 
 
 		 514 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.75 
 
 		 405 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.41 
 
 		 404 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  37.07 
 
 		 450 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  37.07 
 
 		 450 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  37.07 
 
 		 450 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  32.89 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  41.62 
 
 		 481 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2347  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.19 
 
 		 669 aa  99.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.253081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  33.49 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  41.62 
 
 		 481 aa  99.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  41.62 
 
 		 481 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  38.6 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  40.37 
 
 		 411 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  39.53 
 
 		 528 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  37.65 
 
 		 473 aa  99.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  41.01 
 
 		 496 aa  99.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  34.72 
 
 		 451 aa  99.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.9 
 
 		 423 aa  99  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 		 334 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>