42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0898 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0898  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3363  hypothetical protein  97.78 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.486225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1370  hypothetical protein  83.58 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000915569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0872  putative lipoprotein  61.76 
 
 		 155 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1172  putative lipoprotein  65.6 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000330219  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3058  lipoprotein, putative  46.45 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000637333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  60.76 
 
 		 772 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2637  putative lipoprotein  34.21 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0667  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  44.76 
 
 		 274 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1137  hypothetical protein  58.46 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1110  NrfJ-related protein  49.32 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1481  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.78 
 
 		 258 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0110  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  53.62 
 
 		 242 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0569  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  55.38 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2667  NrfJ-related protein  52.17 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00860541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0582  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  53.52 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00229722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1297  NrfJ-related protein  50 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1424  NrfJ-related protein  49.28 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.234475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3155  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1362  NrfJ-related protein  50.72 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3159  NrfJ-related protein  50.72 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875441  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3016  NrfJ-related protein  50.72 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3001  NrfJ-related protein  50.72 
 
 		 100 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3153  hypothetical protein  52.31 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1362  hypothetical protein  48.61 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0317  hypothetical protein  49.28 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3325  nrfJ-related protein  49.28 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1217  NrfJ-related protein  49.28 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1288  NrfJ-related protein  49.28 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00755568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1218  NrfJ-related protein  49.28 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.862525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1283  NrfJ-related protein  49.28 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.743301  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1537  NrfJ-related protein  45.71 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0029  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.02 
 
 		 256 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00147901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1133  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  47.14 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000171522  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2163  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3669  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.75 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0709  hypothetical protein  34.21 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000762305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0887  hypothetical protein  42.19 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0837  hypothetical protein  42.19 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0883  hypothetical protein  42.19 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0899  hypothetical protein  36.92 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2532  hypothetical protein  28.57 
 
 		 97 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>