45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0899 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0899  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0887  hypothetical protein  65.02 
 
 
271 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0883  hypothetical protein  64.31 
 
 
270 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0837  hypothetical protein  65.02 
 
 
270 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0110  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  42.08 
 
 
242 aa  168  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245323  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3669  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  45.65 
 
 
237 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0317  hypothetical protein  39.74 
 
 
243 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1481  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  37.75 
 
 
258 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0582  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  39.66 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00229722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0569  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  40.52 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0667  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.7 
 
 
274 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1133  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  34 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000171522  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0029  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  36.91 
 
 
256 aa  116  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00147901  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0709  hypothetical protein  31.72 
 
 
216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000762305  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1103  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  52.94 
 
 
133 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2522  hypothetical protein  43.01 
 
 
126 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.963067  normal  0.122207 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2333  hypothetical protein  42.72 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2532  hypothetical protein  47.56 
 
 
97 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1370  hypothetical protein  37.4 
 
 
139 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000915569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3155  hypothetical protein  37.63 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3363  hypothetical protein  37.98 
 
 
135 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.486225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1137  hypothetical protein  43.75 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1172  putative lipoprotein  36.67 
 
 
145 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000330219  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0872  putative lipoprotein  37 
 
 
155 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1362  hypothetical protein  37.93 
 
 
126 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467517  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2163  hypothetical protein  36.25 
 
 
110 aa  62  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1110  NrfJ-related protein  41.18 
 
 
100 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792546  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1362  NrfJ-related protein  41.79 
 
 
100 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1297  NrfJ-related protein  41.54 
 
 
100 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3153  hypothetical protein  33.61 
 
 
363 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1283  NrfJ-related protein  41.1 
 
 
100 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.743301  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3016  NrfJ-related protein  41.54 
 
 
100 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3159  NrfJ-related protein  41.54 
 
 
100 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875441  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2667  NrfJ-related protein  41.54 
 
 
100 aa  59.3  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00860541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3001  NrfJ-related protein  41.54 
 
 
100 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1537  NrfJ-related protein  41.54 
 
 
100 aa  58.9  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0898  hypothetical protein  34.65 
 
 
135 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1424  NrfJ-related protein  40 
 
 
100 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.234475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1218  NrfJ-related protein  40 
 
 
100 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.862525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1288  NrfJ-related protein  40 
 
 
100 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00755568  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1217  NrfJ-related protein  40 
 
 
100 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3325  nrfJ-related protein  40 
 
 
100 aa  56.6  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1414  hypothetical protein  37.5 
 
 
65 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3058  lipoprotein, putative  31.76 
 
 
155 aa  49.3  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000637333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  33.8 
 
 
772 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>