36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2532 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2532  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  192  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1414  hypothetical protein  84.62 
 
 		 65 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0899  hypothetical protein  50.72 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.202304  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0887  hypothetical protein  42.03 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.817518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0837  hypothetical protein  43.28 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0883  hypothetical protein  43.28 
 
 		 270 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3669  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  42.65 
 
 		 237 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3153  hypothetical protein  38.81 
 
 		 363 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0667  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.14 
 
 		 274 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1137  hypothetical protein  34.33 
 
 		 332 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2163  hypothetical protein  32.14 
 
 		 110 aa  48.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1481  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  31.65 
 
 		 258 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000462109 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3155  hypothetical protein  34.94 
 
 		 226 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0110  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.33 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0029  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.14 
 
 		 256 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00147901  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1362  hypothetical protein  28.75 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0467517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1133  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  30.48 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000171522  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0317  hypothetical protein  27.45 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1172  putative lipoprotein  40 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000330219  normal  0.0707527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1537  NrfJ-related protein  29.69 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0872  putative lipoprotein  40 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1218  NrfJ-related protein  32.81 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.862525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1288  NrfJ-related protein  32.81 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00755568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1217  NrfJ-related protein  32.81 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3058  lipoprotein, putative  33.82 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000637333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3325  nrfJ-related protein  32.81 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1424  NrfJ-related protein  25.81 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.234475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1283  NrfJ-related protein  31.25 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.743301  normal  0.565826 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3016  NrfJ-related protein  25.81 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3159  NrfJ-related protein  25.81 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875441  hitchhiker  0.00595197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3001  NrfJ-related protein  25.81 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1362  NrfJ-related protein  31.25 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2667  NrfJ-related protein  31.34 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00860541  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0898  hypothetical protein  28 
 
 		 135 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0709  hypothetical protein  22.58 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000762305  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1297  NrfJ-related protein  28.12 
 
 		 100 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>