More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2347 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2347  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 669 aa  1336    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.253081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.79 
 
 		 379 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  41.94 
 
 		 413 aa  111  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  35.34 
 
 		 375 aa  108  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  42.38 
 
 		 344 aa  107  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  38.19 
 
 		 772 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  40.33 
 
 		 384 aa  103  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  37.61 
 
 		 469 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.56 
 
 		 426 aa  103  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  35.78 
 
 		 383 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  35.29 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  35.92 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  37.97 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  36.14 
 
 		 383 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  34.71 
 
 		 459 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  38.29 
 
 		 374 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.68 
 
 		 384 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  35.91 
 
 		 368 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  37.19 
 
 		 411 aa  101  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  34.8 
 
 		 383 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.41 
 
 		 372 aa  100  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.19 
 
 		 410 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  38.27 
 
 		 379 aa  99.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.78 
 
 		 423 aa  99  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  36.4 
 
 		 372 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.73 
 
 		 383 aa  98.2  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  34.1 
 
 		 396 aa  98.2  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.39 
 
 		 481 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  40.24 
 
 		 391 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.07 
 
 		 387 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.39 
 
 		 484 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  39.74 
 
 		 374 aa  97.4  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.84 
 
 		 483 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  33.03 
 
 		 476 aa  97.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.57 
 
 		 515 aa  97.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  39.16 
 
 		 382 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.5 
 
 		 405 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  32.57 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  38.1 
 
 		 396 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 439 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  30.1 
 
 		 417 aa  95.9  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.51 
 
 		 476 aa  96.3  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  37.77 
 
 		 365 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.68 
 
 		 387 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  33.66 
 
 		 420 aa  95.9  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.65 
 
 		 399 aa  95.5  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  31.36 
 
 		 375 aa  94.7  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  39.66 
 
 		 379 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  33.02 
 
 		 471 aa  94.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  37.5 
 
 		 389 aa  94.4  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0972  PDZ/DHR/GLGF  33.99 
 
 		 392 aa  94.4  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.160353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25880  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.32 
 
 		 537 aa  94.4  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  34.26 
 
 		 472 aa  94.4  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.22 
 
 		 387 aa  94.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.86 
 
 		 338 aa  94  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2249  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.67 
 
 		 388 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.637254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.67 
 
 		 404 aa  94  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  39.13 
 
 		 453 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  41.25 
 
 		 418 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  36.48 
 
 		 511 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  38.37 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  33.6 
 
 		 363 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  38.37 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.49 
 
 		 428 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  34 
 
 		 383 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  36.87 
 
 		 399 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0731  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.75 
 
 		 407 aa  92.8  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.415998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  38.37 
 
 		 483 aa  92.8  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  34 
 
 		 397 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1523  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.35 
 
 		 421 aa  92.8  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.415135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3140  putative serine protease protein  36.92 
 
 		 305 aa  92.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  38.37 
 
 		 495 aa  92.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  32.81 
 
 		 363 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  38.37 
 
 		 495 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  42.68 
 
 		 353 aa  92  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  38.37 
 
 		 495 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  38.37 
 
 		 495 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  36 
 
 		 376 aa  92  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  35.39 
 
 		 397 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.46 
 
 		 381 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.23 
 
 		 845 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  37.89 
 
 		 397 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.6 
 
 		 487 aa  91.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  36.07 
 
 		 400 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.52 
 
 		 318 aa  91.3  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  33.03 
 
 		 485 aa  91.3  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.39 
 
 		 334 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  36.02 
 
 		 476 aa  91.3  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  38.37 
 
 		 495 aa  90.9  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  33.84 
 
 		 442 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  38.71 
 
 		 425 aa  90.9  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.33 
 
 		 614 aa  90.9  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.66 
 
 		 506 aa  90.9  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  33.33 
 
 		 408 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  40 
 
 		 351 aa  90.5  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 408 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 377 aa  90.5  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.1 
 
 		 368 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  33.48 
 
 		 397 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  36.9 
 
 		 415 aa  90.1  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>