230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2300 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 532 aa  1068    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  45.81 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.49 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.5 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.69 
 
 		 536 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  61.19 
 
 		 291 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  60.82 
 
 		 291 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.03 
 
 		 558 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 564 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.21 
 
 		 557 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.21 
 
 		 557 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.7 
 
 		 562 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  36.58 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 562 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.98 
 
 		 538 aa  280  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  35.99 
 
 		 554 aa  280  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 587 aa  277  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  35.94 
 
 		 563 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.17 
 
 		 562 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.3 
 
 		 557 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.94 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.36 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 572 aa  258  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.29 
 
 		 538 aa  252  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.81 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 580 aa  250  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.62 
 
 		 613 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  46.21 
 
 		 271 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  33.51 
 
 		 541 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  43.79 
 
 		 303 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  45.88 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  43.46 
 
 		 563 aa  233  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.73 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  37.78 
 
 		 422 aa  231  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.43 
 
 		 568 aa  230  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  45.1 
 
 		 392 aa  229  9e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  40.82 
 
 		 390 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.82 
 
 		 372 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  32.28 
 
 		 529 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.15 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.45 
 
 		 372 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  41.2 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  42.96 
 
 		 584 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  32.46 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  44.62 
 
 		 563 aa  219  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.07 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  42.7 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.64 
 
 		 589 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  42.7 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.42 
 
 		 353 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.22 
 
 		 334 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  43.53 
 
 		 439 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  38.2 
 
 		 341 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  35.78 
 
 		 505 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  39.58 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  39.55 
 
 		 371 aa  204  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  39.6 
 
 		 368 aa  203  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  41.6 
 
 		 831 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  38.58 
 
 		 349 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  37.95 
 
 		 459 aa  200  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  39.92 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  42.7 
 
 		 296 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  40.75 
 
 		 300 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  34.38 
 
 		 388 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  40.3 
 
 		 354 aa  196  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  35.96 
 
 		 358 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  31.83 
 
 		 570 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  37.09 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  37.68 
 
 		 427 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.85 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  40.15 
 
 		 308 aa  188  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  39.15 
 
 		 267 aa  187  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  39.69 
 
 		 284 aa  186  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  41.34 
 
 		 257 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  37.58 
 
 		 302 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  40.64 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  34.88 
 
 		 338 aa  183  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.06 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  36.92 
 
 		 267 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  38.66 
 
 		 318 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  36.91 
 
 		 310 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  38.75 
 
 		 302 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  41.37 
 
 		 300 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  36.98 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  38 
 
 		 368 aa  180  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  39.48 
 
 		 302 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  35.42 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  40.07 
 
 		 301 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  40.81 
 
 		 275 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  38.11 
 
 		 437 aa  178  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  38.91 
 
 		 302 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  38.91 
 
 		 302 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  40.22 
 
 		 279 aa  176  9e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  38.91 
 
 		 302 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  38.91 
 
 		 302 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>