More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1647 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1647  peptidase S41  100 
 
 		 596 aa  1178    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0038  C-terminal processing peptidase  46.53 
 
 		 534 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3204  C-terminal processing peptidase  36.48 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 		 424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 396 aa  156  8e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 		 424 aa  156  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  28.98 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  31.79 
 
 		 572 aa  153  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  31.37 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  33 
 
 		 423 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 		 436 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  32.24 
 
 		 439 aa  151  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 		 436 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  31.02 
 
 		 441 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  30.69 
 
 		 439 aa  150  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  30.14 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  34.85 
 
 		 437 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  32.55 
 
 		 438 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  30.92 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  31.27 
 
 		 439 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  32.36 
 
 		 472 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  33.99 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  32.05 
 
 		 461 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 		 437 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  30.92 
 
 		 445 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  35.35 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  31.54 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 		 439 aa  144  5e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  27.63 
 
 		 450 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  30.72 
 
 		 434 aa  144  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  32.81 
 
 		 507 aa  143  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  28.82 
 
 		 462 aa  143  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  31.78 
 
 		 449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  31.31 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  29.38 
 
 		 440 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  30.16 
 
 		 463 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  29.38 
 
 		 440 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  34.58 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  30.28 
 
 		 444 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 438 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  29.25 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  33.11 
 
 		 430 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  30.67 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  34.22 
 
 		 498 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  32.78 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  29.06 
 
 		 428 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  28.01 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  33.11 
 
 		 430 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  27.99 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  27.99 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 428 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  31.07 
 
 		 444 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  31.85 
 
 		 426 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  29.07 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  32.89 
 
 		 398 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  33.03 
 
 		 437 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  26.47 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  30.82 
 
 		 441 aa  138  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  31.1 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  29.63 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  30.56 
 
 		 482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  29.49 
 
 		 565 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  31.08 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 		 482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 		 448 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  30.21 
 
 		 456 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  32.56 
 
 		 437 aa  136  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  32.48 
 
 		 400 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  30.95 
 
 		 443 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  29.38 
 
 		 438 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  30.27 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  33.45 
 
 		 569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  30.67 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  29.8 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  28.34 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  28.23 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  29.35 
 
 		 443 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  29.77 
 
 		 457 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  30.72 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  28.9 
 
 		 439 aa  135  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  32.25 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  28.2 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  29.87 
 
 		 437 aa  134  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  28.3 
 
 		 491 aa  134  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  31.27 
 
 		 431 aa  134  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 		 455 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  27.93 
 
 		 401 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  34.75 
 
 		 399 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  32.11 
 
 		 566 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>