More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2181 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  100 
 
 		 191 aa  370  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 196 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0375  transcriptional regulator, TetR family  48.37 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00856394  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0106  transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.431172  normal  0.200565 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25370  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.422708  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1181  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000215765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0948  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.627177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1013  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1253  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1799  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 213 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1477  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  31.11 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
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NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1859  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1797  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125509  normal  0.0456013 
 
 
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NC_011205  SeD_A1658  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.166061 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.84 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
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NC_008726  Mvan_5842  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25935  normal  0.516433 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0851  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780744  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3746  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3762  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013457  VEA_000004  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4822  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_5772  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_4730  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.88373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2729  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
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CP001509  ECD_04117  predicted transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_33680  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4834  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04081  hypothetical protein  27.78 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
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NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2631  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05594  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0084  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.382504  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2260  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0561114  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4506  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.165942  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0493  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0117598 
 
 
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NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1394  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
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CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.13 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
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NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  26.13 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
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NC_010172  Mext_3418  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  0.510685 
 
 
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CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0989177  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_0960  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.115896  normal  1 
 
 
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