64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1536 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  41.56 
 
 		 1590 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.68 
 
 		 1686 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1370  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.9 
 
 		 1299 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1536  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  100 
 
 		 1568 aa  3220    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.36 
 
 		 1669 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.29 
 
 		 1627 aa  733    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.34 
 
 		 1482 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2913  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.83 
 
 		 1488 aa  954    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0246207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2038  hypothetical protein  46.77 
 
 		 1895 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1017  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.46 
 
 		 1270 aa  234  7.000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000312457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2557  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  27.08 
 
 		 1946 aa  213  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3425  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.13 
 
 		 1288 aa  201  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2558  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  27.04 
 
 		 1714 aa  190  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3432  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.01 
 
 		 1281 aa  181  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1694  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.13 
 
 		 1296 aa  169  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0847615  decreased coverage  0.00494316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2155  Tfp pilus assembly protein, tip-associated adhesin PilY1  26.62 
 
 		 1581 aa  136  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2909  type IV fimbrial biogenesis protein PilY1  26.78 
 
 		 1309 aa  133  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.940828 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2518  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.19 
 
 		 1245 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0737  type IV pilus assembly protein PilY1  22.56 
 
 		 991 aa  112  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.465349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1066  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1014 aa  111  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.797091  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0561  PilY1 gene product  23.21 
 
 		 1228 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.762386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0027  PilY1-like protein  23.87 
 
 		 1215 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1703  fimbrial assembly protein  24.77 
 
 		 1521 aa  105  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0874412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1765  fimbrial assembly protein  24.41 
 
 		 1521 aa  105  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0958  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.88 
 
 		 1227 aa  103  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.327934 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0497  pilus tip-associated protein  23.21 
 
 		 1225 aa  102  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0023  pilus tip-associated protein  22.65 
 
 		 1214 aa  102  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.639019  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3225  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  23.96 
 
 		 1181 aa  102  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3036  putative Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1  26.17 
 
 		 1544 aa  97.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.583565  normal  0.438129 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1382  PilY1 protein  25 
 
 		 1254 aa  94  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.660708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2885  fimbrial assembly protein  23.31 
 
 		 1493 aa  94.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694358  normal  0.827989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2274  fimbrial assembly protein  25.44 
 
 		 1470 aa  92.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.211915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5194  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  24.73 
 
 		 1155 aa  86.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.948738  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0665  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1169 aa  85.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0674  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.16 
 
 		 1122 aa  84.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.920198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0717  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  23.57 
 
 		 1122 aa  82  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.441406  normal  0.313915 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0682  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1169 aa  80.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0787  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.55 
 
 		 1223 aa  78.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60310  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  22.85 
 
 		 1158 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3408  pilus tip-associated protein  24.9 
 
 		 1273 aa  76.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01324  PilY1  27.17 
 
 		 1327 aa  70.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.338969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1073  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 		 1378 aa  68.6  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3551  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.79 
 
 		 1500 aa  68.6  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1700  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 		 1378 aa  68.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0967  type IV pilin biogenesis protein, putative  23.85 
 
 		 1030 aa  66.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2913  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  29.78 
 
 		 1148 aa  65.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518902  normal  0.0349155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3103  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  31.46 
 
 		 1115 aa  64.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0724  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related signal peptide protein  35.2 
 
 		 1323 aa  60.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.542451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0210  Neisseria PilC domain protein  21.89 
 
 		 1174 aa  60.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0317884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.25 
 
 		 1722 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0661  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.25 
 
 		 1723 aa  57  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0627  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like  20.62 
 
 		 1722 aa  56.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4843  type IV pilus-associated protein, putative  22.05 
 
 		 1014 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.930911  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0019  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.63 
 
 		 1287 aa  53.5  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.582284  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0672  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  27.86 
 
 		 1666 aa  53.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0705474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2825  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.74 
 
 		 1517 aa  52.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2668  Pyrrolo-quinoline quinone  41.67 
 
 		 1200 aa  52  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.66041  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2539  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  26.49 
 
 		 1205 aa  51.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  25.61 
 
 		 1127 aa  50.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5197  FG-GAP repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1182 aa  49.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.578151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3188  type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  25.48 
 
 		 1154 aa  48.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444073  normal  0.594589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1298  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.01 
 
 		 1186 aa  48.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.991628 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  33.59 
 
 		 1111 aa  48.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1153  type IV pilin biogenesis protein, putative  26.75 
 
 		 1223 aa  47  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.591357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>