178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1255 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1255  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  399  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.847765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  46.67 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  41.61 
 
 		 218 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  39.75 
 
 		 218 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  39.88 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  41.76 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 425 aa  135  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  38.92 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  36.32 
 
 		 327 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  36.32 
 
 		 327 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  36.32 
 
 		 327 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  35.54 
 
 		 193 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  36.52 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  32.66 
 
 		 363 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4695  hypothetical protein  34.87 
 
 		 235 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0489031  normal  0.712544 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  35.06 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  37.78 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  33.71 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 340 aa  98.2  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  34.39 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 221 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 221 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  33.09 
 
 		 356 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  33.08 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0714  hypothetical protein  29.33 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2319  hypothetical protein  29.33 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2235  hypothetical protein  29.33 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0728  hypothetical protein  28.67 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1666  hypothetical protein  28.67 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1711  hypothetical protein  28.67 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1919  hypothetical protein  28.67 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854236  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0594  hypothetical protein  28.67 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.45 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1066  hypothetical protein  30.95 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.032179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3791  electron transport protein SCO1/SenC  28.75 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  31.06 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  35.35 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  32.2 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  35.19 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2329  hypothetical protein  34.04 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1570  hypothetical protein  34.83 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.310526  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  31.58 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  29.56 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0109  SCO1/SenC family protein  27.69 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.614112  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1366  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0508  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.588285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1595  hypothetical protein  33.71 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0258875  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0648  hypothetical protein  33.71 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0599933  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  29.73 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  31.78 
 
 		 444 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  31.75 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  33.61 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  29.01 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  29.01 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1756  hypothetical protein  32.58 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0582  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  33.7 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  36.08 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0189  hypothetical protein  30.97 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  28.12 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  27.69 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  35.96 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01390  hypothetical protein  31.78 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  31.96 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  27.4 
 
 		 276 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  29.51 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  30.89 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  31.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  35.79 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  36.05 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  25.52 
 
 		 276 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  28.21 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  27.78 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  34.95 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  28.12 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1843  electron transport protein SCO1/SenC  30.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.607401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  30.86 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  28.19 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  25.18 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  35.11 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  28.87 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  29.9 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  27.59 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  29.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  29.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  29.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  29.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  29.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>