More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5423 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5423  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 821 aa  1619    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106532  normal  0.207547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6025  UvrD/REP helicase  44.01 
 
 		 737 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3740  UvrD/REP helicase  42.09 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2325  hypothetical protein  38.86 
 
 		 759 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0788129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3085  UvrD/Rep helicase  41.34 
 
 		 717 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.173371  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35190  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.31 
 
 		 737 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0355  UvrD/REP helicase  33.29 
 
 		 714 aa  329  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2728  UvrD/REP helicase  32.89 
 
 		 699 aa  326  9e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0810  UvrD/REP helicase  31.42 
 
 		 703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0826  UvrD/REP helicase  31.42 
 
 		 703 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0064  putative DNA helicase  32.28 
 
 		 696 aa  308  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1406  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 708 aa  300  6e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.450912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1352  UvrD/REP helicase  31.93 
 
 		 712 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541991 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3882  UvrD/REP helicase  30.43 
 
 		 704 aa  295  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.229228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5811  ATP-dependent DNA helicase, UvrD/REP family  30.43 
 
 		 704 aa  295  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859027 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4831  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.31 
 
 		 704 aa  294  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2733  UvrD/REP helicase  32.49 
 
 		 705 aa  289  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  29.8 
 
 		 705 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1419  UvrD/REP helicase  31.75 
 
 		 706 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0110  putative DNA helicase  36.11 
 
 		 659 aa  276  8e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.609607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2326  putative DNA helicase  30.24 
 
 		 711 aa  233  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4174  UvrD/REP helicase  34.64 
 
 		 716 aa  231  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2329  superfamily protein I DNA/RNA helicase  35.2 
 
 		 679 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  34.24 
 
 		 603 aa  229  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2859  UvrD/REP helicase  29.22 
 
 		 690 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2943  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  30.56 
 
 		 696 aa  210  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8440  UvrD/REP helicase  30.59 
 
 		 685 aa  209  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1320  superfamily I DNA/RNA helicase  27.11 
 
 		 683 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.875169  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3032  UvrD/REP family ATP-dependent DNA helicase  32.22 
 
 		 687 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.722257  normal  0.242361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1246  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 662 aa  187  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.176029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3349  hypothetical protein  32.34 
 
 		 673 aa  175  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.038988  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  29.91 
 
 		 734 aa  137  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2259  UvrD/REP helicase  28.44 
 
 		 710 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0960519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4063  UvrD/REP helicase  28.65 
 
 		 697 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21557  normal  0.035765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  27.32 
 
 		 700 aa  126  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4504  UvrD/REP helicase  29.79 
 
 		 809 aa  125  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0743  plasmid stabilization system  28.37 
 
 		 712 aa  124  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3757  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 695 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000385426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5351  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 695 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.149775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0589  UvrD/REP helicase  28.62 
 
 		 663 aa  91.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4061  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  27.61 
 
 		 1107 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  18.93 
 
 		 819 aa  80.9  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  23.67 
 
 		 815 aa  80.9  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1546  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.924385  hitchhiker  0.000024327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2959  NERD domain-containing protein  29.87 
 
 		 625 aa  74.7  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0055  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0545819  normal  0.378623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  28.08 
 
 		 615 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  27.36 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  28.37 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  27.21 
 
 		 601 aa  63.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1421 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  26.15 
 
 		 619 aa  61.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  35.71 
 
 		 721 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  28.22 
 
 		 1232 aa  58.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 		 717 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4005  hypothetical protein  25.7 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.467683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  45.45 
 
 		 797 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  45.45 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3974  hypothetical protein  25.59 
 
 		 607 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335001 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  55.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.58 
 
 		 660 aa  55.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  29.44 
 
 		 722 aa  55.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  26.78 
 
 		 1142 aa  55.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  56.2  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.21 
 
 		 619 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  45.45 
 
 		 797 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  32.87 
 
 		 722 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1549  hypothetical protein  40 
 
 		 465 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.400172  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3289  ATP-dependent DNA helicase REP protein  40 
 
 		 705 aa  54.7  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  48.53 
 
 		 787 aa  54.7  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  41.43 
 
 		 672 aa  54.7  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28 
 
 		 745 aa  54.3  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02993  hypothetical protein  25.76 
 
 		 612 aa  54.3  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145899  normal  0.116581 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1726  UvrD/REP helicase  40.48 
 
 		 593 aa  53.9  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  39.47 
 
 		 749 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  33.33 
 
 		 727 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2446  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 		 1141 aa  53.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.79 
 
 		 659 aa  53.5  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  39.47 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5490  UvrD/REP helicase  35.06 
 
 		 587 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0996527  normal  0.395354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  38.36 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4204  UvrD/REP helicase  36.47 
 
 		 599 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  32.39 
 
 		 726 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3485  UvrD/REP helicase  38.57 
 
 		 706 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.162451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3158  UvrD/REP helicase  38.57 
 
 		 706 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.154088  normal  0.513844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0116  hypothetical protein  26.8 
 
 		 335 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  40.85 
 
 		 764 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3327  ATP-dependent DNA helicase Rep  38.57 
 
 		 704 aa  52.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0992503  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.58 
 
 		 671 aa  52.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  39.71 
 
 		 680 aa  52.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  34.88 
 
 		 613 aa  52  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.91 
 
 		 730 aa  52  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.91 
 
 		 730 aa  52  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  42.25 
 
 		 744 aa  52  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>