92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3830 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  100 
 
 		 94 aa  194  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  87.23 
 
 		 368 aa  170  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  85.11 
 
 		 356 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  81.91 
 
 		 368 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  80.85 
 
 		 173 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  84.04 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  86.17 
 
 		 368 aa  151  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  87.23 
 
 		 370 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  82.98 
 
 		 368 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  85.11 
 
 		 368 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  81.32 
 
 		 395 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  55.56 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  51.55 
 
 		 357 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  53.76 
 
 		 333 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  53.76 
 
 		 182 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  51.61 
 
 		 355 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  51.61 
 
 		 355 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  49.46 
 
 		 355 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  49.46 
 
 		 299 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  52.69 
 
 		 235 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  49.46 
 
 		 355 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  50.54 
 
 		 316 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  49.46 
 
 		 355 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  51.11 
 
 		 236 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  50 
 
 		 359 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  47.31 
 
 		 185 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  84.09 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  45.05 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  49.32 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  54.1 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  51.56 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  40.86 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  38.71 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  38.89 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  38.46 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  38.46 
 
 		 197 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  37 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  47.69 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  46.15 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 		 341 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  36.56 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  36.26 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  57.78 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  32.63 
 
 		 355 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  45 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  45 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  45 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  31.58 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  45 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  45 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 		 341 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 283 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  35.44 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  35.44 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  38.33 
 
 		 276 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  36.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  36.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  32.31 
 
 		 233 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  36.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  36.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  36.67 
 
 		 314 aa  44.3  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  38.33 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  29.31 
 
 		 273 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  28.99 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  28.99 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  28.99 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  36.67 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  28.99 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  28.99 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  30.56 
 
 		 309 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  36.21 
 
 		 138 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  36.67 
 
 		 278 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  36.67 
 
 		 251 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  36.21 
 
 		 116 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  34.92 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  30 
 
 		 289 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  30 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  38.1 
 
 		 349 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  35 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2777  transposase  33.33 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  35 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  32.81 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5023  integrase catalytic region  34.43 
 
 		 292 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>