More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3500 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  84.15 
 
 		 289 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  83.77 
 
 		 289 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  83.77 
 
 		 289 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  83.77 
 
 		 289 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  83.77 
 
 		 289 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  68.75 
 
 		 283 aa  352  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  70.31 
 
 		 282 aa  345  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  58.87 
 
 		 309 aa  338  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  66.23 
 
 		 231 aa  334  9e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  66.23 
 
 		 231 aa  334  9e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  66.23 
 
 		 231 aa  334  9e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  66.23 
 
 		 231 aa  334  9e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  67.25 
 
 		 286 aa  333  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  61.97 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  61.97 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  61.97 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  62.83 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  62.83 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  62.83 
 
 		 240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  60 
 
 		 276 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  58.44 
 
 		 278 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  54.84 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  55.24 
 
 		 278 aa  293  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  57.58 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  61.35 
 
 		 209 aa  291  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  61.35 
 
 		 209 aa  291  5e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  56.12 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  52.42 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  79.25 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  62.2 
 
 		 174 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  62.2 
 
 		 174 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  73.15 
 
 		 195 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  73.15 
 
 		 195 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  58.17 
 
 		 153 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0120  hypothetical protein  76.86 
 
 		 205 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  46.26 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 345 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  47.14 
 
 		 358 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  43.81 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  43.81 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  43.61 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  40.61 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  40.61 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  40.61 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  40.61 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  40.61 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  40.61 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  43.17 
 
 		 284 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  43.17 
 
 		 283 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  45 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  45 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  45 
 
 		 279 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  42.41 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  42.41 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  42.41 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  43.39 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  44.16 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  44.16 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  44.16 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  44.16 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  44.16 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  44.44 
 
 		 227 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  40.48 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  40.48 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  43.64 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  43.64 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  39.74 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  39.74 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  39.22 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  38.96 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  43.12 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  43.12 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  43.12 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  40.44 
 
 		 274 aa  165  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>