More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0469 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  89.58 
 
 		 355 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  90.42 
 
 		 355 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  89.58 
 
 		 355 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  100 
 
 		 355 aa  710    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  86.76 
 
 		 355 aa  628  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  91.64 
 
 		 299 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  86.35 
 
 		 333 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  68.48 
 
 		 303 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 359 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  55.43 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  85.45 
 
 		 235 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 368 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  52.53 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  87.36 
 
 		 182 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  51.97 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  51.42 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  50.14 
 
 		 370 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  55.59 
 
 		 316 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  82.46 
 
 		 185 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  51.7 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  93.42 
 
 		 161 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  44.18 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  37.36 
 
 		 355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  89.92 
 
 		 133 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  37.54 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  67.7 
 
 		 147 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  52.61 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  43.71 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  35.76 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  56 
 
 		 214 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  51.76 
 
 		 173 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  34.31 
 
 		 341 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  34.02 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  33.72 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  86.67 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  32.84 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  32.99 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  28.99 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  52.87 
 
 		 214 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  50.32 
 
 		 189 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  83.12 
 
 		 81 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  76.71 
 
 		 198 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  61.46 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  47.1 
 
 		 130 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  81.54 
 
 		 65 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  83.08 
 
 		 65 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  91.38 
 
 		 412 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  92.73 
 
 		 98 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  32.74 
 
 		 197 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  32.74 
 
 		 181 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  51.61 
 
 		 96 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  40.56 
 
 		 143 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  59.26 
 
 		 172 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  49.04 
 
 		 130 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  49.46 
 
 		 94 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  93.48 
 
 		 54 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  37.23 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  37.23 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  52.94 
 
 		 120 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  20.66 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  34.23 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  34.55 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  64.91 
 
 		 68 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  28.05 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  26.81 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  26.81 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  26.81 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  26.29 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  26.81 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  30.87 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  30.87 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  36.07 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  39.18 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  25.86 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  25.86 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  25.86 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  27.51 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  25.11 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  25.11 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  25.11 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  24.28 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  26.86 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  25.96 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  27.95 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>