273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4376 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  89.24 
 
 		 356 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  100 
 
 		 395 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  88.67 
 
 		 368 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  89.52 
 
 		 368 aa  624  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  89.8 
 
 		 368 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  86.12 
 
 		 368 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  87.54 
 
 		 368 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  80.45 
 
 		 370 aa  551  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  88.52 
 
 		 252 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  52.56 
 
 		 355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  52.27 
 
 		 355 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  51.42 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  50.85 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  51.42 
 
 		 355 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  48.31 
 
 		 357 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  52.33 
 
 		 299 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  47.25 
 
 		 347 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  80.92 
 
 		 173 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  92.26 
 
 		 189 aa  282  9e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  86.59 
 
 		 214 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  52.17 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  45.99 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  38.24 
 
 		 355 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  39.12 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  38.93 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  50.71 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  46.5 
 
 		 303 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  36.99 
 
 		 341 aa  199  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  38.39 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  57.56 
 
 		 214 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  50 
 
 		 235 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  37.46 
 
 		 350 aa  193  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  34.2 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  87.5 
 
 		 130 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  52.2 
 
 		 182 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  34.49 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  47.9 
 
 		 185 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  79.17 
 
 		 96 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  92.94 
 
 		 120 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  36.5 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  83.15 
 
 		 172 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  55.22 
 
 		 130 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  35.33 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  50.32 
 
 		 161 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  81.32 
 
 		 94 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  55.86 
 
 		 147 aa  123  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  38.2 
 
 		 197 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  38.2 
 
 		 181 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  53.04 
 
 		 133 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  45.19 
 
 		 156 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  45.19 
 
 		 156 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  33.78 
 
 		 153 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  33.78 
 
 		 153 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  40.5 
 
 		 185 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  53.85 
 
 		 153 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  46.67 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  41.82 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  38.05 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  22.75 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0484  hypothetical protein  87.8 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  25.89 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  25.89 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  25.89 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  45.21 
 
 		 81 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  25.12 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  25.12 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  25.12 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  23.7 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  25.12 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  25.12 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  25.12 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  23.51 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  23.08 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  27.84 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  23.75 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  25.2 
 
 		 309 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  25.6 
 
 		 309 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  25.2 
 
 		 309 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  25.2 
 
 		 309 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0535  hypothetical protein  56.52 
 
 		 121 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  24.67 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  24.67 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  24.67 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  44.87 
 
 		 98 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  25.31 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  24.67 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  24.67 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  32.99 
 
 		 106 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  28.76 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  22.73 
 
 		 286 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  28.7 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  27.53 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  41.54 
 
 		 65 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  28.7 
 
 		 411 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>