More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1404 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  92.66 
 
 		 368 aa  677    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  90.76 
 
 		 368 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  88.32 
 
 		 368 aa  656    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  100 
 
 		 368 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  90.22 
 
 		 368 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  92.42 
 
 		 356 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  89.52 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  84.05 
 
 		 370 aa  591  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  89.14 
 
 		 252 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 355 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  53.93 
 
 		 355 aa  355  6.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  53.93 
 
 		 355 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 355 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  52.25 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  49.86 
 
 		 357 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  55 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  85.55 
 
 		 173 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  89.41 
 
 		 189 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  47.32 
 
 		 347 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  55.15 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  87.8 
 
 		 214 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  47.59 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  39.12 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  54.5 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  39.63 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  53.3 
 
 		 235 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  37.28 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  36.81 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  41.41 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  37.16 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  36.31 
 
 		 341 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  55.49 
 
 		 182 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  57.56 
 
 		 214 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  36.39 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  34.58 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  87.62 
 
 		 130 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  50.9 
 
 		 185 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 364 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  84.38 
 
 		 96 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  37.69 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  93.18 
 
 		 120 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  59.7 
 
 		 130 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  83.15 
 
 		 172 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  36.88 
 
 		 342 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  82.98 
 
 		 94 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  50.32 
 
 		 161 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  41.57 
 
 		 197 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  41.57 
 
 		 181 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  58.56 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  54.78 
 
 		 133 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  43.7 
 
 		 156 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  43.7 
 
 		 156 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  37.76 
 
 		 143 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0484  hypothetical protein  83.93 
 
 		 79 aa  92.8  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  34.46 
 
 		 153 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  34.46 
 
 		 153 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  52.58 
 
 		 153 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  23.53 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  43.75 
 
 		 171 aa  86.3  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  38.84 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  46.67 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  38.94 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  51.32 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  26.2 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  26.2 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  26.2 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  45.45 
 
 		 81 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  26.07 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  26.07 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  26.07 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  26.07 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  26.39 
 
 		 285 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  26.39 
 
 		 285 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  25.63 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  36.08 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  24.78 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  46.15 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  27.31 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  25.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  25.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  23.97 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  26.36 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  26.36 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  26.36 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  25.68 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  24.23 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  25.68 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  25.68 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  25.68 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  25.68 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  43.08 
 
 		 65 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0535  hypothetical protein  56.52 
 
 		 121 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  22.98 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  22.98 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  22.98 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>