More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1595 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  100 
 
 
289 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  99.63 
 
 
273 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  78.02 
 
 
273 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  95.5 
 
 
229 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  95.5 
 
 
235 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  95.5 
 
 
235 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  96.17 
 
 
184 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  71.05 
 
 
233 aa  348  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  54.65 
 
 
270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  94.03 
 
 
150 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  75 
 
 
183 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0981  integrase core subunit  96.47 
 
 
94 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156943  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  100 
 
 
58 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  94.83 
 
 
58 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  33.18 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  29.59 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 
275 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  29.74 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  30.58 
 
 
296 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  30.58 
 
 
296 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  28.15 
 
 
278 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  31.7 
 
 
273 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  31.7 
 
 
273 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  31.7 
 
 
273 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  31.7 
 
 
273 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  31.7 
 
 
273 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  29.83 
 
 
374 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 
374 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  29.83 
 
 
374 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  29.83 
 
 
374 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  29.83 
 
 
374 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  29.83 
 
 
374 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  29.83 
 
 
374 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0996  integrase, catalytic region  30.62 
 
 
295 aa  102  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  32.16 
 
 
279 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  32.16 
 
 
279 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  30.22 
 
 
296 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2229  integrase catalytic subunit  30.04 
 
 
290 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000141221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  31.03 
 
 
245 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  32.16 
 
 
279 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1145  integrase catalytic subunit  28.89 
 
 
280 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.631339  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  26.74 
 
 
271 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  26.74 
 
 
271 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  26.74 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  32.18 
 
 
273 aa  99  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  32.18 
 
 
273 aa  99  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  32.18 
 
 
273 aa  99  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  27.57 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  27.57 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  27.57 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  27.57 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
282 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  30.63 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  30.63 
 
 
279 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  30.94 
 
 
393 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  28.64 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  28.63 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  33.91 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  33.91 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  33.91 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  33.91 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  31.21 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  33.91 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  29.89 
 
 
280 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4393  integrase catalytic subunit  29.32 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4141  hypothetical protein  29.32 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  28.94 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  28.94 
 
 
306 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  28.94 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  28.94 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  28.94 
 
 
307 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 
370 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  28.57 
 
 
370 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>