More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3409 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  100 
 
 		 299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  91.64 
 
 		 355 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  89.97 
 
 		 355 aa  547  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  88.96 
 
 		 355 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  88.63 
 
 		 355 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  86.62 
 
 		 355 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  87.82 
 
 		 333 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  89.62 
 
 		 359 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  90.34 
 
 		 303 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  86.85 
 
 		 235 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  91.21 
 
 		 182 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  54.13 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  55 
 
 		 368 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  54.67 
 
 		 356 aa  310  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  54.67 
 
 		 368 aa  309  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  55.33 
 
 		 368 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  89.22 
 
 		 185 aa  306  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  55 
 
 		 368 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  55 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  52.33 
 
 		 395 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  52.74 
 
 		 316 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  51.99 
 
 		 370 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  43.85 
 
 		 347 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  50.52 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  41.26 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  68.26 
 
 		 147 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  40.56 
 
 		 355 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  54.71 
 
 		 173 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  34.84 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  91.11 
 
 		 236 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  45.81 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  32.53 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  86.96 
 
 		 161 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  54.19 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  34 
 
 		 341 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  32.18 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  33.1 
 
 		 341 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  32.75 
 
 		 350 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  89.61 
 
 		 81 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  90.77 
 
 		 65 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  86.15 
 
 		 65 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  52.34 
 
 		 214 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  75.34 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  47.1 
 
 		 130 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  53.85 
 
 		 214 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  33.33 
 
 		 181 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  33.33 
 
 		 197 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  42.25 
 
 		 143 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  84.21 
 
 		 98 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  80.95 
 
 		 133 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  51.04 
 
 		 96 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  55.56 
 
 		 172 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  53.47 
 
 		 189 aa  95.9  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  49.46 
 
 		 94 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  22.01 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  32.48 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  33.64 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  27.88 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  27.88 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  27.88 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  27.88 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  27.88 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  26.42 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  27.23 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  38.24 
 
 		 106 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  26.52 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  31.94 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  31.94 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  38.95 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  38.95 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1645  integrase catalytic subunit  26.94 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  26.39 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  26.09 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  25.78 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  25.78 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  25.78 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  25.78 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  28.33 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  27.9 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 371 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  27.04 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  27.9 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  28.27 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>