103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2787 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  100 
 
 		 106 aa  221  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  92.45 
 
 		 341 aa  213  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  91.51 
 
 		 350 aa  212  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  87.74 
 
 		 341 aa  205  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  82.08 
 
 		 341 aa  191  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  76.19 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  76.19 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 		 364 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  39.25 
 
 		 355 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  38.39 
 
 		 357 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  37.11 
 
 		 173 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  37.38 
 
 		 355 aa  67  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  37.11 
 
 		 368 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  37.11 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  39.22 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  39.18 
 
 		 355 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  40.2 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  38.32 
 
 		 333 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  40.2 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  39.22 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  36.08 
 
 		 368 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  38.24 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  39.22 
 
 		 355 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  39.22 
 
 		 355 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  38.83 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  35.85 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  38.24 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  39.6 
 
 		 359 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  39.22 
 
 		 355 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  37.11 
 
 		 368 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  35.71 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  38.71 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  38.54 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  33.02 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  41.51 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  29.36 
 
 		 355 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  38.89 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  38.03 
 
 		 347 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  39.06 
 
 		 303 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  51.22 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  31.07 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  31.07 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  37.88 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  37.88 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  37.88 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  37.31 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  37.31 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  27.71 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  31.73 
 
 		 355 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3668  integrase catalytic subunit  29.27 
 
 		 267 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  32.91 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  32.91 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  32.43 
 
 		 283 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1432  Integrase catalytic region  30.38 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  32.91 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  32.91 
 
 		 279 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  29.63 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  29.63 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  29.63 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  29.63 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  34.85 
 
 		 267 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  32.43 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  25.71 
 
 		 273 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  25 
 
 		 289 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  30.3 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  31.65 
 
 		 342 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  31.51 
 
 		 314 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  28.4 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0907  hypothetical protein  31.43 
 
 		 307 aa  40.8  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.129322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  31.58 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  31.58 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  31.58 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  31.58 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  31.58 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  34.29 
 
 		 270 aa  40  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  27.14 
 
 		 273 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1854  integrase catalytic subunit  30.99 
 
 		 189 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.578694  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 309 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 309 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  32.1 
 
 		 248 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  32.1 
 
 		 248 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  32.1 
 
 		 248 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  32.1 
 
 		 248 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  32.1 
 
 		 248 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>