More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2408 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  100 
 
 
278 aa  577  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  99.64 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  99.64 
 
 
278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  99.26 
 
 
269 aa  553  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  67.27 
 
 
278 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  67.27 
 
 
278 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  67.27 
 
 
278 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  67.27 
 
 
278 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  67.63 
 
 
278 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  65.83 
 
 
278 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  65.83 
 
 
278 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  65.83 
 
 
278 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  65.83 
 
 
278 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  65.33 
 
 
278 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  66.54 
 
 
260 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  65.33 
 
 
278 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  65.83 
 
 
278 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  70.33 
 
 
248 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  61.87 
 
 
279 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  61.87 
 
 
279 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  60.36 
 
 
278 aa  349  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  61.87 
 
 
279 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  61.87 
 
 
279 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  61.89 
 
 
268 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  61.89 
 
 
268 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  60 
 
 
278 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  60 
 
 
278 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  60 
 
 
278 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  60 
 
 
278 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  60 
 
 
278 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  61.89 
 
 
268 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  61.13 
 
 
268 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  63.28 
 
 
259 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  63.28 
 
 
259 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  63.28 
 
 
259 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  63.28 
 
 
259 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  62.89 
 
 
259 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  55.11 
 
 
283 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  55.11 
 
 
283 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  54.74 
 
 
283 aa  338  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  70.32 
 
 
222 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  57.89 
 
 
267 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  57.89 
 
 
267 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  56.51 
 
 
270 aa  322  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  56.51 
 
 
270 aa  322  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  56.51 
 
 
270 aa  322  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  54.1 
 
 
270 aa  318  9e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  54.1 
 
 
270 aa  318  9e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  57.79 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  57.79 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  57.79 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  57.79 
 
 
252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  58.78 
 
 
249 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  58.78 
 
 
249 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
261 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
261 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
261 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
261 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
261 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  54.23 
 
 
261 aa  300  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  56.88 
 
 
277 aa  299  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  56.88 
 
 
277 aa  299  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  56.88 
 
 
277 aa  299  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  55 
 
 
261 aa  296  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  55 
 
 
261 aa  295  5e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  54.62 
 
 
261 aa  294  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0026  transposase  51.32 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0307  transposase orfB, IS150-related  50.94 
 
 
269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3662  integrase core domain protein  51.72 
 
 
265 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3620  transposase  51.72 
 
 
265 aa  281  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0498053  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0392  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 
252 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0748  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 
252 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.401665  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4363  transposase  58.77 
 
 
215 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0267789  hitchhiker  2.99756e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  51.82 
 
 
278 aa  270  2e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0194  transposase  50.2 
 
 
253 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.501333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1068  IS861, transposase OrfB  52.4 
 
 
277 aa  265  8e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1527  IS861, transposase OrfB  52.03 
 
 
277 aa  263  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  50 
 
 
261 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  50 
 
 
261 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  50 
 
 
261 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  50 
 
 
261 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  50 
 
 
261 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  50 
 
 
261 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  50 
 
 
261 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>