More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3414 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  90.49 
 
 		 368 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  92.66 
 
 		 368 aa  675    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  100 
 
 		 368 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  91.01 
 
 		 356 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  90.76 
 
 		 368 aa  674    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  92.93 
 
 		 368 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  89.8 
 
 		 395 aa  614  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  83.78 
 
 		 370 aa  591  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  91.86 
 
 		 252 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  54.78 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  54.78 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 355 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  50.7 
 
 		 357 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  55.33 
 
 		 299 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  87.86 
 
 		 173 aa  311  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  48.51 
 
 		 347 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  90 
 
 		 189 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  56.62 
 
 		 333 aa  295  8e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  87.8 
 
 		 214 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  47.24 
 
 		 296 aa  232  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  39.71 
 
 		 355 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  54.98 
 
 		 359 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  40.25 
 
 		 355 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  54.72 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  37.28 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  42.68 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  37.16 
 
 		 341 aa  206  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  36.52 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  57.69 
 
 		 182 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  36.09 
 
 		 350 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  36.02 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  55.81 
 
 		 214 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  87.62 
 
 		 130 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  30.12 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  88.54 
 
 		 96 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  52.1 
 
 		 185 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  38.58 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  94.32 
 
 		 120 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  61.19 
 
 		 130 aa  155  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  85.39 
 
 		 172 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  86.17 
 
 		 94 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  36.71 
 
 		 342 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  50.32 
 
 		 161 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  40.51 
 
 		 197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  41.01 
 
 		 181 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  58.56 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  53.91 
 
 		 133 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  42.22 
 
 		 156 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  42.22 
 
 		 156 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  35.14 
 
 		 153 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  35.14 
 
 		 153 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0484  hypothetical protein  83.93 
 
 		 79 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  51.55 
 
 		 153 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  51.11 
 
 		 236 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  23.44 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  36.92 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  34.71 
 
 		 196 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  41.44 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  52.63 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  48.05 
 
 		 81 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  25.45 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  25.45 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  25.45 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  38.14 
 
 		 106 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  24.39 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  27.27 
 
 		 375 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  47.69 
 
 		 65 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  27.27 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  27.38 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  27.27 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  46.15 
 
 		 65 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  24.4 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  26.84 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  26.84 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  28.38 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  23.38 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  23.38 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  23.38 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  23.38 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  23.38 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  57.78 
 
 		 98 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  23.75 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  27.78 
 
 		 361 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 390 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 364 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27.78 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>