158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0499 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 368 aa  184  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  88.54 
 
 		 368 aa  176  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  88.54 
 
 		 173 aa  175  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  86.46 
 
 		 356 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  88.54 
 
 		 368 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  84.38 
 
 		 368 aa  156  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 370 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  85.42 
 
 		 368 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  84.04 
 
 		 94 aa  143  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  79.17 
 
 		 395 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  57.73 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  53.12 
 
 		 355 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  51.04 
 
 		 299 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  55.91 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  51 
 
 		 357 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  52.08 
 
 		 333 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  51.61 
 
 		 355 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  54.84 
 
 		 235 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  50 
 
 		 355 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  52.13 
 
 		 316 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  53.76 
 
 		 355 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  52.17 
 
 		 359 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  52.22 
 
 		 236 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  50 
 
 		 355 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  52.08 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  84.78 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  46.25 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  47.5 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  53.85 
 
 		 342 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  46.51 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  37.89 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  37.89 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  38.71 
 
 		 355 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  33.68 
 
 		 355 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  33.66 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  47.69 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  34.74 
 
 		 355 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  36.56 
 
 		 355 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  46.15 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  35.71 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  33.67 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  33.68 
 
 		 364 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  56 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  32.65 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  32.29 
 
 		 350 aa  52  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  32.29 
 
 		 341 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  39.06 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  39.06 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  39.06 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  39.06 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  39.06 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  38.81 
 
 		 174 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  38.81 
 
 		 174 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  39.13 
 
 		 272 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  38.81 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  38.81 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  38.81 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  32.84 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  32.84 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  37.93 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  29.85 
 
 		 233 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0536  putative transposase  33.33 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1351  transposase and inactivated derivatives  33.33 
 
 		 336 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1381  putative integrase  33.33 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  32.43 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  26.87 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  32.88 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  32.88 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  26.87 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  32.86 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  32.88 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2777  transposase  36.21 
 
 		 79 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375746 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1841  integrase catalytic subunit  31.88 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  34.48 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  34.48 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  34.48 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  34.48 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  34.48 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>