More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0485 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  99.68 
 
 
315 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  100 
 
 
315 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  50.32 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  50.32 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  50.32 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  50.16 
 
 
318 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  50.16 
 
 
318 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  50.16 
 
 
318 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  50 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  50 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  50.16 
 
 
316 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  49.84 
 
 
316 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  50 
 
 
316 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  50.16 
 
 
316 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  49.53 
 
 
316 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  49.53 
 
 
316 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  51.26 
 
 
313 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  51.43 
 
 
315 aa  276  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  41.41 
 
 
329 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
358 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
358 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
358 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
358 aa  222  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  41.41 
 
 
358 aa  222  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  43.49 
 
 
318 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  40.18 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  40.18 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 
333 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 
333 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 
333 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  42.06 
 
 
333 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  41.74 
 
 
333 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  42.01 
 
 
321 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 
329 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 
329 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  39.45 
 
 
329 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 
325 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  42.81 
 
 
330 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  42.81 
 
 
330 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  42.51 
 
 
330 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  42.39 
 
 
347 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  42.51 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  41.67 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  40.37 
 
 
481 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  39.39 
 
 
335 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  39.8 
 
 
309 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  38.3 
 
 
328 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  38.18 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  38.58 
 
 
328 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  37.97 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  36.97 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  36.39 
 
 
351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  36.39 
 
 
351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  36.76 
 
 
335 aa  172  7.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  36.47 
 
 
335 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  36.8 
 
 
335 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  36.47 
 
 
335 aa  169  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  48.7 
 
 
195 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  40.43 
 
 
422 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  35.6 
 
 
365 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  34.85 
 
 
334 aa  152  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  57.28 
 
 
99 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  44.52 
 
 
208 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  32.2 
 
 
597 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2660  integrase catalytic subunit  28.4 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.271661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  31.12 
 
 
391 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  31.12 
 
 
391 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  31.12 
 
 
391 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  31.75 
 
 
607 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2923  transposase  29.04 
 
 
377 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  25.76 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0789  transposase  29.04 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  29.04 
 
 
377 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0294035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2890  transposase  29.04 
 
 
377 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0319653  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5697  transposase  29.04 
 
 
377 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308774  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5108  transposase  29.04 
 
 
377 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341163  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4342  Integrase catalytic region  28.34 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>