More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1236 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  99.43 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  99.43 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  100 
 
 		 174 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  99.43 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  100 
 
 		 174 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  73.62 
 
 		 276 aa  270  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  74.17 
 
 		 153 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  66.09 
 
 		 250 aa  250  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  66.09 
 
 		 278 aa  250  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  68.07 
 
 		 278 aa  249  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  64.37 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  63.79 
 
 		 251 aa  244  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  64.37 
 
 		 250 aa  243  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  63.41 
 
 		 289 aa  241  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  63.41 
 
 		 289 aa  241  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  63.41 
 
 		 289 aa  241  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  63.41 
 
 		 289 aa  241  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  63.41 
 
 		 289 aa  241  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  65.22 
 
 		 284 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  62.2 
 
 		 265 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  64.15 
 
 		 283 aa  235  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  61.39 
 
 		 267 aa  227  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  64.05 
 
 		 282 aa  227  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  61.39 
 
 		 267 aa  227  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  61.39 
 
 		 271 aa  227  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  62.66 
 
 		 231 aa  227  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  62.66 
 
 		 231 aa  227  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  62.66 
 
 		 231 aa  227  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  62.66 
 
 		 231 aa  227  8e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  61.01 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  61.01 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  62.11 
 
 		 309 aa  224  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  62.75 
 
 		 286 aa  221  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  54.61 
 
 		 227 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  54 
 
 		 279 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  54 
 
 		 279 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  52.03 
 
 		 283 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  52.03 
 
 		 284 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 279 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  53.33 
 
 		 279 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  51.33 
 
 		 273 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  51.33 
 
 		 273 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  51.33 
 
 		 273 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  49.67 
 
 		 285 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  49.67 
 
 		 284 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  49.67 
 
 		 284 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  52.67 
 
 		 279 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  49.67 
 
 		 284 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  49.67 
 
 		 284 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  49.67 
 
 		 285 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 358 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  48.08 
 
 		 345 aa  151  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  47.44 
 
 		 273 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  41.1 
 
 		 260 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  42.77 
 
 		 274 aa  142  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4081  integrase catalytic region  41.03 
 
 		 210 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  48.94 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  44.3 
 
 		 297 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  44.52 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  44.52 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  44.67 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  41.67 
 
 		 290 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  40.38 
 
 		 276 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  40.49 
 
 		 284 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  41.67 
 
 		 290 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  39.88 
 
 		 269 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  39.88 
 
 		 269 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  41.33 
 
 		 280 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  39.88 
 
 		 269 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  39.88 
 
 		 269 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  39.13 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  41.94 
 
 		 372 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  41.94 
 
 		 372 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  41.94 
 
 		 372 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  41.76 
 
 		 309 aa  137  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>