More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02984 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  100 
 
 		 233 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  76.79 
 
 		 273 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  71.05 
 
 		 273 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  71.05 
 
 		 289 aa  348  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  72.6 
 
 		 235 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  72.6 
 
 		 235 aa  343  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  72.6 
 
 		 229 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  72.78 
 
 		 184 aa  284  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  58.77 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  75.76 
 
 		 150 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  65 
 
 		 183 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01380  integrase core domain protein  93.22 
 
 		 60 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  29.96 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1519  Integrase catalytic region  29.73 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2592  integrase catalytic subunit  33.53 
 
 		 276 aa  101  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000687739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0236  integrase catalytic subunit  30.7 
 
 		 275 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3361  transposase  30.08 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0048  integrase  30.08 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1737  putative transposase  34.88 
 
 		 276 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3739  integrase catalytic region  28 
 
 		 285 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  30.96 
 
 		 393 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  29.18 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  31.17 
 
 		 372 aa  95.5  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0940  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 306 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.110898  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1895  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 306 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.875209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0981  integrase core subunit  62.86 
 
 		 94 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156943  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1294  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1760  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1902  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.484439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1010  IS3 family transposase orfB  30.63 
 
 		 302 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1072  IS3 family transposase orfB  30.63 
 
 		 302 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1116  IS3 family transposase orfB  30.63 
 
 		 293 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1015  IS3 family transposase orfB  30.63 
 
 		 293 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  76.36 
 
 		 58 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  76.36 
 
 		 58 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3397  Integrase catalytic region  28.39 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0018  Integrase catalytic region  28.39 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5938  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1305  integrase catalytic subunit  27.8 
 
 		 275 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1653  integrase catalytic subunit  27.8 
 
 		 275 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.99187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1711  integrase catalytic subunit  27.8 
 
 		 275 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2285  integrase catalytic subunit  27.8 
 
 		 275 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1325  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00777894  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5485  Integrase catalytic region  33.73 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.729196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  30.29 
 
 		 279 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  30.29 
 
 		 279 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0083  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0977  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.231813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0292  integrase catalytic subunit  29.36 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  29.87 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  29.87 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  29.87 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  29.87 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  30.21 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  30.21 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  29.87 
 
 		 273 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  30.21 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5448  Integrase catalytic region  33.73 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5643  Integrase catalytic region  33.73 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6414  integrase catalytic region  24.89 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4375  integrase catalytic subunit  31.94 
 
 		 276 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  29.09 
 
 		 279 aa  88.6  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2773  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0144895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1886  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1881  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2012  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00348364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2000  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.887951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1993  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2135  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1687  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1976  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0994913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1691  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1954  integrase catalytic subunit  27.39 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2112  integrase catalytic subunit  27.39 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0585  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0591  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.418555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0919  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1656  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.629851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1661  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1674  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1676  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1683  integrase catalytic subunit  26.69 
 
 		 278 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05650  integrase  34.16 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0624  putative transposase B  31.98 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1233  putative transposase B  31.98 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05621  hypothetical protein  34.16 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01946  hypothetical protein  34.16 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>