More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0782 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  203  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  97.73 
 
 		 274 aa  186  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  59.54 
 
 		 309 aa  155  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  59.54 
 
 		 309 aa  155  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  59.54 
 
 		 375 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  59.84 
 
 		 309 aa  152  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  59.63 
 
 		 260 aa  151  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  60.32 
 
 		 309 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  60.98 
 
 		 309 aa  150  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  64.42 
 
 		 269 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  64.42 
 
 		 269 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  59.84 
 
 		 309 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  64.42 
 
 		 269 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  64.42 
 
 		 269 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  59.84 
 
 		 309 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  59.84 
 
 		 309 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  66.06 
 
 		 284 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  58.73 
 
 		 309 aa  146  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  58.73 
 
 		 309 aa  146  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  58.73 
 
 		 309 aa  146  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  65.42 
 
 		 223 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  53.85 
 
 		 307 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  62.86 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 235 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  55.56 
 
 		 290 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  65.66 
 
 		 273 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  65.66 
 
 		 273 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  65.66 
 
 		 273 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  65.66 
 
 		 273 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  65.66 
 
 		 273 aa  140  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  53.73 
 
 		 312 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  62.86 
 
 		 290 aa  137  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  62.86 
 
 		 290 aa  137  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  65.96 
 
 		 372 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  62.14 
 
 		 264 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  57.94 
 
 		 306 aa  136  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  62.86 
 
 		 290 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  62.86 
 
 		 290 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  59.43 
 
 		 309 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  52.07 
 
 		 298 aa  130  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  53.77 
 
 		 393 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  59.62 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  54.21 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  51.04 
 
 		 280 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  52.22 
 
 		 279 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  48.11 
 
 		 280 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  66.22 
 
 		 231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  44.64 
 
 		 234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  44.64 
 
 		 234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  44.64 
 
 		 305 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  44.64 
 
 		 234 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  44.64 
 
 		 305 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  51.58 
 
 		 276 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  51.58 
 
 		 276 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  51.58 
 
 		 276 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  51.58 
 
 		 276 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28750  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000102722  decreased coverage  0.000000000142523 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  47.22 
 
 		 269 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  49.49 
 
 		 274 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0001  integrase core subunit  49.47 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.274298 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4081  integrase catalytic region  49.47 
 
 		 210 aa  106  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  49.47 
 
 		 276 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 273 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  48.39 
 
 		 273 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1818  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.961912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1837  IS407A, transposase OrfB  48.6 
 
 		 277 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00170274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>