226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4622 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  688    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  51.7 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  53.31 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  52.27 
 
 		 355 aa  279  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  50.28 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  49.55 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  50.52 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  47.92 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  52.82 
 
 		 359 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  59.06 
 
 		 235 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  56.28 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  79.61 
 
 		 182 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  36.26 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  79.61 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  75.73 
 
 		 185 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  37.1 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  36.27 
 
 		 368 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  36.56 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  35.92 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  36.01 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  35.21 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  32.19 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  71.26 
 
 		 98 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  55.45 
 
 		 173 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  39.69 
 
 		 172 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  59.6 
 
 		 133 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  59.6 
 
 		 161 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  80 
 
 		 147 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  29.86 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  75.41 
 
 		 236 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  48.98 
 
 		 130 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  42.17 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  78.26 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  39.58 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  53.85 
 
 		 96 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  87.18 
 
 		 54 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  36.67 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  33.67 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  52.63 
 
 		 94 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  44.09 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  29.59 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  29.59 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  55.56 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  75 
 
 		 65 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  30.81 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  75 
 
 		 65 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  34.48 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  29.57 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  31.46 
 
 		 184 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  31.46 
 
 		 229 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  31.46 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  31.46 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  30.34 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  30.34 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  29.63 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  31.46 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  36.36 
 
 		 262 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 431 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 390 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 390 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 374 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  31.25 
 
 		 362 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  31.25 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 385 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 385 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 373 aa  50.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 356 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  31.25 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>