More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0485 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  100 
 
 		 359 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  94.02 
 
 		 235 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  68.33 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  90.57 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  89.62 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  87.74 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  88.68 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  87.26 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  87.74 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  89.39 
 
 		 303 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  90.06 
 
 		 182 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  63.76 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  81.93 
 
 		 185 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  52.82 
 
 		 342 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  54.03 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  54.5 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  53.55 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  54.98 
 
 		 368 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  54.5 
 
 		 368 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  53.55 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  50.47 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  86.73 
 
 		 147 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  50.71 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  51.64 
 
 		 370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  53.85 
 
 		 173 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  85.56 
 
 		 236 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  42.58 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  39.53 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  90.54 
 
 		 81 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  38.43 
 
 		 355 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  31.94 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  85.94 
 
 		 65 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  84.62 
 
 		 65 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  47.45 
 
 		 130 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  29.41 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  62.96 
 
 		 172 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  31.33 
 
 		 197 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  31.33 
 
 		 181 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  52.17 
 
 		 96 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  40.43 
 
 		 143 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  77.19 
 
 		 98 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  32.67 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  33.51 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  62.14 
 
 		 198 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  32.99 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  33.51 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  50 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  31.72 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  31.72 
 
 		 153 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  52.24 
 
 		 252 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  39.6 
 
 		 106 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  28.4 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  29.01 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  28.4 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  28.4 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  28.4 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  28.4 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  28.4 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  27.78 
 
 		 235 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  30.57 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  30.57 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  30.57 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  30.57 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  30.2 
 
 		 273 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  30.57 
 
 		 262 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  28.4 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  27.16 
 
 		 309 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  30.57 
 
 		 262 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  28.81 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  28.81 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  28.81 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  30.97 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  28.81 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  28.81 
 
 		 314 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  38.2 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  28.64 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  30.13 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  28.7 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  25.84 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  25.84 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  25.84 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  25.84 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  28.07 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  30.19 
 
 		 174 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  28.57 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  33.77 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  28.07 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27.93 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  28.18 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  28.07 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>