268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4409 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  100 
 
 		 303 aa  607  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  69.09 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  68.47 
 
 		 355 aa  414  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  68.48 
 
 		 355 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  66.97 
 
 		 355 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  65.76 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  90.34 
 
 		 299 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  81.66 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  89.39 
 
 		 359 aa  362  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  86.36 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  90 
 
 		 182 aa  315  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  83.23 
 
 		 185 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  89.47 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  43.77 
 
 		 357 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  47.92 
 
 		 342 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  43.27 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  44.26 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  45.53 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  45.91 
 
 		 368 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  87.5 
 
 		 147 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  43.56 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  42.9 
 
 		 368 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  47.01 
 
 		 395 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  47.77 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  43.2 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  36.59 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  54.68 
 
 		 173 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  36.18 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  89.61 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  29.1 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  43.06 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  86.36 
 
 		 81 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  87.5 
 
 		 161 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  81.94 
 
 		 133 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  30.65 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  94.34 
 
 		 65 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  47.79 
 
 		 130 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  82.46 
 
 		 98 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  33.58 
 
 		 197 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  33.58 
 
 		 181 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  84 
 
 		 65 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  59.26 
 
 		 172 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  38.78 
 
 		 143 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 364 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  75 
 
 		 198 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  85.42 
 
 		 412 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  26.85 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  33.12 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  36.55 
 
 		 252 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  32.5 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  32.5 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  95 
 
 		 51 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  44.58 
 
 		 96 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  61.02 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  85.71 
 
 		 54 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  55.74 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  57.69 
 
 		 94 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  30.77 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  30.77 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  88.57 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  31.79 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  31.79 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  31.79 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  31.79 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  30.67 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  30.67 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  31.79 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  30.67 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  28.4 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  30.18 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  30.06 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  26.54 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  38.16 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  34.35 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  34.35 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  34.35 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  37.33 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  37.33 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  27.16 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  37.33 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  37.33 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  32.26 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  37.33 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>