More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0527 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  100 
 
 
349 aa  706    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
378 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
369 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
361 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
376 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
390 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
367 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
378 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
379 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
371 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
379 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
373 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
359 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  70.72 
 
 
364 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
362 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
385 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  70.72 
 
 
362 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
374 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
411 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
356 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
356 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
360 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
378 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
381 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
379 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  70.72 
 
 
359 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
358 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
362 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
390 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
364 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
378 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
371 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
390 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
356 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
355 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
378 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
358 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  70.64 
 
 
378 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
364 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
383 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
360 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
385 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
360 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
365 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
364 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
386 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
356 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
431 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
373 aa  508  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
371 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
359 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
364 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
366 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
358 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
356 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
378 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  70.72 
 
 
361 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  70.43 
 
 
359 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  70.27 
 
 
310 aa  435  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  69.41 
 
 
336 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  28.07 
 
 
375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  30.57 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  30.57 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  30.57 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  30.69 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  30.69 
 
 
327 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  32.99 
 
 
325 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  32.99 
 
 
325 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  27.49 
 
 
374 aa  112  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  32.98 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  32.07 
 
 
338 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  32.07 
 
 
338 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  32.07 
 
 
338 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  31.14 
 
 
339 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  26.23 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  28.34 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  28.34 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  28.34 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  28.34 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  28.34 
 
 
346 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  26.03 
 
 
321 aa  89  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  25.75 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>