More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0044 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  97.87 
 
 		 374 aa  710    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  100 
 
 		 375 aa  764    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0940  hypothetical protein  95.48 
 
 		 234 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000789536  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  28.12 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  28.61 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  28.12 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  28.61 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  28.61 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  28.12 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 385 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 364 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  28.61 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  28.52 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  29.7 
 
 		 310 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  29.77 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  29.45 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  28.08 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  28.08 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  28.08 
 
 		 320 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  29.97 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  29.97 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  28.97 
 
 		 325 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  28.97 
 
 		 325 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  29.74 
 
 		 325 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  25.84 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  26.35 
 
 		 333 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  25.75 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  26.2 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  21.14 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  21.14 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  21.14 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  21.14 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  21.14 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  21.14 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  21.14 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  21.79 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  26.51 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  22.48 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  25.08 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  28.28 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  23.49 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  23.75 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>