More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2485 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  98.89 
 
 
360 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  100 
 
 
379 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  100 
 
 
383 aa  717    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2762  Integrase catalytic region  100 
 
 
381 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  100 
 
 
371 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  98.34 
 
 
385 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  99.72 
 
 
373 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  99.16 
 
 
369 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  99.16 
 
 
374 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  100 
 
 
378 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  100 
 
 
378 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  99.16 
 
 
359 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  100 
 
 
359 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  100 
 
 
378 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  100 
 
 
367 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  100 
 
 
358 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  98.08 
 
 
385 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  99.72 
 
 
364 aa  718    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  100 
 
 
356 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  100 
 
 
390 aa  718    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  98.34 
 
 
362 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  100 
 
 
356 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  99.16 
 
 
360 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  100 
 
 
365 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  100 
 
 
364 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2305  Integrase catalytic region  99.16 
 
 
386 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.96472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  100 
 
 
360 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  100 
 
 
355 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  100 
 
 
379 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  100 
 
 
378 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  100 
 
 
364 aa  742    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  100 
 
 
378 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  99.44 
 
 
378 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  100 
 
 
409 aa  716    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  100 
 
 
378 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  99.44 
 
 
411 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1690  Integrase catalytic region  99.72 
 
 
358 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  99.44 
 
 
379 aa  724    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  100 
 
 
361 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  100 
 
 
431 aa  718    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  100 
 
 
376 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  98.89 
 
 
390 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  99.72 
 
 
366 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  100 
 
 
364 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  99.72 
 
 
359 aa  716    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2964  Integrase catalytic region  99.44 
 
 
356 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3016  Integrase catalytic region  99.44 
 
 
356 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  98.07 
 
 
371 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3091  Integrase catalytic region  100 
 
 
358 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0808941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3104  Integrase catalytic region  100 
 
 
356 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.299563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  99.72 
 
 
373 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3181  Integrase catalytic region  100 
 
 
362 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.299267  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  721    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3369  TROVE domain protein  100 
 
 
359 aa  722    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3500  hypothetical protein  98.34 
 
 
364 aa  723    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000943241  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  99.16 
 
 
371 aa  720    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  100 
 
 
390 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  719    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  98.68 
 
 
336 aa  602  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  599  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  70.72 
 
 
349 aa  478  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  31.56 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  31.56 
 
 
327 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  32.32 
 
 
320 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  32.32 
 
 
320 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  32.32 
 
 
320 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  27.94 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 
339 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0690  Integrase catalytic region  29.83 
 
 
321 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168341  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  27.11 
 
 
374 aa  106  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  32.06 
 
 
325 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  32.06 
 
 
325 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  32.06 
 
 
325 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  28.07 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  29.6 
 
 
597 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  28.07 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00368  Transposase  40.54 
 
 
165 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  28.66 
 
 
335 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  28.96 
 
 
335 aa  86.7  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  28.96 
 
 
320 aa  86.3  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  28.05 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1602  Integrase catalytic region  28.25 
 
 
607 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.090134  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  26.38 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  26.09 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  26.09 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  26.09 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  26.09 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  23.8 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  30.6 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  30.6 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.81 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.81 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.81 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  27.22 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  28.81 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  27.22 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  27.22 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>