28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4652 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  95.65 
 
 
355 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  88 
 
 
355 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  95.65 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  93.48 
 
 
355 aa  86.7  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  97.78 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  91.3 
 
 
355 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  89.13 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  85.71 
 
 
303 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  87.18 
 
 
342 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  86.84 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  65.22 
 
 
357 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  66.67 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  88.46 
 
 
412 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  60 
 
 
214 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  58.7 
 
 
368 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  58.7 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  58.7 
 
 
356 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  58.7 
 
 
368 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  58.7 
 
 
368 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  58.7 
 
 
368 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  58.7 
 
 
395 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  58.7 
 
 
252 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  58.7 
 
 
368 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  94.74 
 
 
51 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  54.35 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  52.17 
 
 
214 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  54.35 
 
 
370 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>