48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0538 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  68.26 
 
 		 299 aa  213  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  67.7 
 
 		 355 aa  208  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  68.94 
 
 		 355 aa  207  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  89.29 
 
 		 333 aa  206  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  68.32 
 
 		 355 aa  206  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  90.09 
 
 		 355 aa  204  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  86.73 
 
 		 359 aa  201  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 303 aa  201  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  86.61 
 
 		 355 aa  201  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  86.61 
 
 		 182 aa  200  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  84.82 
 
 		 235 aa  195  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  82 
 
 		 185 aa  174  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  89.61 
 
 		 316 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  59.46 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 368 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  58.56 
 
 		 368 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  57.66 
 
 		 368 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  55.86 
 
 		 357 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  55.86 
 
 		 395 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  58.25 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  53.1 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  80 
 
 		 342 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  44.86 
 
 		 347 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  41.44 
 
 		 355 aa  88.2  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  41.44 
 
 		 355 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  48.28 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  33.59 
 
 		 355 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  41.18 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  34.34 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  35.79 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  30.63 
 
 		 355 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  51.67 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  43.48 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  32.46 
 
 		 364 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  86.96 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0044  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 375 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000337574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1393  Integrase catalytic region  29.37 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000348935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 350 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  32.11 
 
 		 254 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  33.87 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 341 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  29.73 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  29.73 
 
 		 153 aa  40.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  29.73 
 
 		 341 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0535  hypothetical protein  43.48 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>