More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0474 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  89.86 
 
 
355 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  100 
 
 
355 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  89.58 
 
 
355 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  91.55 
 
 
355 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  86.76 
 
 
355 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  88.96 
 
 
299 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  89.3 
 
 
333 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  66.97 
 
 
303 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  56.55 
 
 
357 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  87.26 
 
 
359 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  84.51 
 
 
235 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  55.06 
 
 
368 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  54.21 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  54.78 
 
 
368 aa  355  7.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  53.93 
 
 
356 aa  354  1e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  54.21 
 
 
368 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  53.65 
 
 
368 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  88.46 
 
 
182 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  52.56 
 
 
395 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  50.84 
 
 
370 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  57.23 
 
 
316 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  82.46 
 
 
185 aa  294  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  53.31 
 
 
342 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  88.16 
 
 
161 aa  266  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  42.99 
 
 
347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  92.44 
 
 
133 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  38.06 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  37.5 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  68.32 
 
 
147 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  54.03 
 
 
252 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  45.1 
 
 
296 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  54.29 
 
 
214 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  33.8 
 
 
355 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  53.53 
 
 
173 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  90 
 
 
236 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  32.55 
 
 
341 aa  162  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  32.84 
 
 
341 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
341 aa  159  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  31.07 
 
 
350 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  31.4 
 
 
355 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  53.85 
 
 
214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  50.96 
 
 
189 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  27.51 
 
 
364 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  89.04 
 
 
81 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  90.77 
 
 
65 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  84.62 
 
 
65 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  75.32 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  59.38 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  91.38 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  46.32 
 
 
130 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  53.12 
 
 
96 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  96.08 
 
 
51 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  41.55 
 
 
143 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  30.49 
 
 
181 aa  97.1  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  88.24 
 
 
98 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  30.49 
 
 
197 aa  96.3  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  56.18 
 
 
172 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  51.61 
 
 
94 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  91.3 
 
 
54 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  37.23 
 
 
156 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  37.23 
 
 
156 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  51.76 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  64.91 
 
 
68 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  36.89 
 
 
185 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  19.46 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  34.23 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  34.55 
 
 
196 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  38.83 
 
 
106 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  93.94 
 
 
70 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  26.38 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  26.38 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  25.96 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  25.96 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  29.52 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  25.96 
 
 
309 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  27 
 
 
409 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27 
 
 
373 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  27 
 
 
373 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  29.52 
 
 
262 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  29.52 
 
 
262 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  29.52 
 
 
262 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  27 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  27 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  27 
 
 
383 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  29.52 
 
 
262 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3325  hypothetical protein  27 
 
 
361 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683157  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  27 
 
 
411 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  27 
 
 
379 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  27 
 
 
385 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  27 
 
 
371 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  27 
 
 
364 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  27 
 
 
358 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  27 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3080  Integrase catalytic region  27 
 
 
371 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  27 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  27 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  27 
 
 
390 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  27 
 
 
367 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  26.22 
 
 
273 aa  59.7  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>