More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3039 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  90.49 
 
 		 368 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  91.3 
 
 		 368 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  89.67 
 
 		 368 aa  662    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  89.04 
 
 		 356 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  100 
 
 		 368 aa  735    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  90.22 
 
 		 368 aa  655    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  86.49 
 
 		 370 aa  611  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  87.54 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  88.24 
 
 		 252 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  53.65 
 
 		 355 aa  352  8.999999999999999e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  53.65 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 355 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  52.25 
 
 		 355 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  51.97 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  49.86 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  88.44 
 
 		 173 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  55 
 
 		 299 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  90 
 
 		 189 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  48.81 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  89.63 
 
 		 214 aa  288  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  55.51 
 
 		 333 aa  285  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  48.62 
 
 		 296 aa  235  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  40.29 
 
 		 355 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  42.67 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  44.09 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  53.55 
 
 		 359 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  36.9 
 
 		 341 aa  210  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  52.83 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  36.47 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  36.52 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  35.12 
 
 		 341 aa  202  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  56.59 
 
 		 182 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  58.14 
 
 		 214 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  35.17 
 
 		 350 aa  196  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  34.58 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  87.62 
 
 		 130 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  30.41 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  51.5 
 
 		 185 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  85.42 
 
 		 96 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  93.18 
 
 		 120 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  37.69 
 
 		 316 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  60.45 
 
 		 130 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  83.15 
 
 		 172 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  85.11 
 
 		 94 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  36.18 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  49.68 
 
 		 161 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  40.51 
 
 		 197 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  59.46 
 
 		 147 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  41.01 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  51.3 
 
 		 133 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  41.35 
 
 		 156 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  41.35 
 
 		 156 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  37.76 
 
 		 143 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  35.81 
 
 		 153 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  35.81 
 
 		 153 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0484  hypothetical protein  82.14 
 
 		 79 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  52.58 
 
 		 153 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  23.65 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  38.84 
 
 		 185 aa  85.9  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  41.96 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  44.19 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  51.32 
 
 		 198 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  49.32 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  25 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  25 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  25 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  37.11 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  47.69 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  46.15 
 
 		 65 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  24.69 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0535  hypothetical protein  37.37 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.870667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  23.18 
 
 		 272 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  31.11 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  31.11 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  31.11 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  31.11 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  31.11 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  30.83 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  25.78 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  25.78 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>