59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4397 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  344  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  85.39 
 
 
368 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  85.39 
 
 
368 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  83.15 
 
 
395 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  83.15 
 
 
368 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  86.9 
 
 
173 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  82.02 
 
 
356 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  87.95 
 
 
368 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  83.15 
 
 
368 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  80.9 
 
 
252 aa  147  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  82.02 
 
 
214 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  82.02 
 
 
189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  82.56 
 
 
370 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  68.35 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  77.94 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  39.69 
 
 
342 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  57.83 
 
 
357 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  61.45 
 
 
182 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  51.96 
 
 
333 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  62.96 
 
 
359 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  59.04 
 
 
316 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  55.56 
 
 
299 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  62.96 
 
 
235 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  58.02 
 
 
355 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  55.56 
 
 
355 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  59.26 
 
 
355 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  54.44 
 
 
303 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  56.18 
 
 
355 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  55.06 
 
 
214 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  59.26 
 
 
355 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  56.63 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  53.93 
 
 
161 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  84.78 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  54.88 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  81.63 
 
 
120 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  44.05 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  44.05 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  48.28 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  84.09 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  46.91 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  42.86 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  41.56 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  44.09 
 
 
355 aa  64.7  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  40.66 
 
 
341 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  33.72 
 
 
355 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  40.66 
 
 
341 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  41.18 
 
 
355 aa  62.4  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  40.66 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  40.66 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 
341 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  44.07 
 
 
296 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  40.66 
 
 
350 aa  59.7  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  36.9 
 
 
185 aa  57.4  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  55.17 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  42.86 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  42.86 
 
 
153 aa  51.2  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  55.81 
 
 
236 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  51.22 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  32.53 
 
 
364 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>