More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2864 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  90.62 
 
 		 341 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  98.1 
 
 		 350 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 341 aa  702    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  87.39 
 
 		 341 aa  622  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  41.55 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  80.79 
 
 		 156 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  80.79 
 
 		 156 aa  252  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  83.97 
 
 		 153 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  83.97 
 
 		 153 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  92.45 
 
 		 106 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  35.71 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  65.1 
 
 		 185 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  35.47 
 
 		 368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  35.71 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  36.99 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  35.12 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  35.91 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  35.36 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  34.02 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  35.06 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  33.14 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  33.63 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  33.04 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  33.72 
 
 		 355 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  31.96 
 
 		 355 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  31.38 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  31.27 
 
 		 355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  33.1 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  32.14 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  33.45 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  33.21 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  30.68 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  33.65 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  41.21 
 
 		 214 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  29.7 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  26.54 
 
 		 362 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  37.76 
 
 		 189 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  35.06 
 
 		 214 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  33.92 
 
 		 173 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  26.85 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  33.51 
 
 		 359 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  32.02 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  34.53 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  34.97 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  33.15 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  31.28 
 
 		 197 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  31.28 
 
 		 181 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  38.33 
 
 		 130 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  33.13 
 
 		 185 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  33.54 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  35.1 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  27.63 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  27.63 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  27.63 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  27.63 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  27.63 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  35.92 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  47.62 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  24.57 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  27.92 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  22.46 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  26.11 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  22.67 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  22.67 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  22.46 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  22.67 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  22.67 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  22.67 
 
 		 273 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  27.38 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  23.29 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  23.01 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0374  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1079  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1083  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2031  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2056  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2130  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  21.91 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0029  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0037  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  21.91 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  21.91 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0054  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  21.91 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0066  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  21.91 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0091  ISSod1, transposase OrfB  21.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>