More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2734 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  100 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0374  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0495  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0657  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0684  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0892  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0983  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1024  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1079  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1083  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1129  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1134  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1465  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1515  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1904  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2026  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2031  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2056  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2130  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2135  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2169  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2171  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2315  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2369  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2462  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2734  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3398  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3570  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3606  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3610  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4183  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4277  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4294  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4300  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4442  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4580  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0024  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0483506  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0029  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0037  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0054  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0066  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0091  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
269 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  98.14 
 
 
386 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4596  integrase catalytic region  98.14 
 
 
269 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0260013  normal  0.930794 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4660  integrase catalytic region  98.14 
 
 
269 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.462988  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2548  integrase catalytic region  97.4 
 
 
269 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259686  normal  0.0518637 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4231  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1332  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2305  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.209191  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1740  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.453724  normal  0.15404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1556  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2818  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00277944  normal  0.404607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3584  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.321833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3113  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2987  integrase catalytic region  96.65 
 
 
269 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0425  integrase catalytic subunit  96.28 
 
 
269 aa  540  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1049  integrase catalytic subunit  96.28 
 
 
269 aa  540  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3021  integrase catalytic subunit  96.28 
 
 
269 aa  540  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3189  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4460  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0132  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4449  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0972291  normal  0.591502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2651  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1073  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0656  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1727  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3550  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3065  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174203  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2006  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373277  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1928  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2008  integrase catalytic subunit  96.65 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.106721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1118  integrase catalytic subunit  96.28 
 
 
269 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2660  integrase catalytic subunit  96.28 
 
 
269 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4312  integrase catalytic subunit  96.36 
 
 
251 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4401  transposase IS3/IS911 family protein  98.23 
 
 
346 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.518435 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4653  integrase catalytic region  98.23 
 
 
229 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0145  ISSod1, transposase OrfB  100 
 
 
214 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3668  integrase catalytic subunit  60.98 
 
 
267 aa  346  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  43.89 
 
 
378 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  43.89 
 
 
378 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  43.89 
 
 
378 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  43.89 
 
 
378 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1638  integrase catalytic subunit  43.87 
 
 
302 aa  219  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330516  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1823  Integrase catalytic region  41.54 
 
 
270 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.484824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1559  Integrase catalytic region  41.54 
 
 
270 aa  218  8.999999999999998e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  43.46 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>