38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1131 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  353  8.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  72.62 
 
 
355 aa  260  6.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  72.51 
 
 
196 aa  259  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  67.26 
 
 
355 aa  238  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1379  hypothetical protein  63.55 
 
 
129 aa  149  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.18612  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  35.4 
 
 
368 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  43.64 
 
 
252 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  43.75 
 
 
368 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  40.52 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  41.82 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  41.07 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  41.96 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  41.82 
 
 
368 aa  81.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  34.97 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  40.87 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  40.17 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  41.44 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  31.29 
 
 
296 aa  79  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  34.38 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  30.63 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  34.57 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  39.32 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  34.67 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  30.82 
 
 
355 aa  73.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  35.04 
 
 
355 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  34.19 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  30.91 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  34.23 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  32.48 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  35.34 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  34.19 
 
 
355 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  38.46 
 
 
333 aa  68.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  34.23 
 
 
355 aa  67.4  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  43.21 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  43.21 
 
 
156 aa  62  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  38.89 
 
 
198 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  38.46 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  27.73 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>