55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0496 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 368 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  57.56 
 
 		 395 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  58.14 
 
 		 368 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  56.98 
 
 		 368 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  55.81 
 
 		 368 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  57.56 
 
 		 356 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  57.56 
 
 		 368 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  53.07 
 
 		 252 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  55.43 
 
 		 355 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  55.43 
 
 		 355 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  56 
 
 		 355 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 355 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  54.29 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  52.33 
 
 		 370 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  55.56 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  54.88 
 
 		 347 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  47.7 
 
 		 357 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  51.53 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  53.29 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  90.36 
 
 		 153 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  53.53 
 
 		 296 aa  141  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  38.55 
 
 		 341 aa  124  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  52.34 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  37.43 
 
 		 341 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  41.21 
 
 		 341 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  56.36 
 
 		 133 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  37.8 
 
 		 350 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  39.62 
 
 		 355 aa  104  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  42.75 
 
 		 156 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  42.75 
 
 		 156 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  40.43 
 
 		 355 aa  101  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  50 
 
 		 333 aa  95.1  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  55.06 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  33.88 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  33.52 
 
 		 355 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  51.65 
 
 		 130 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  27.78 
 
 		 364 aa  84.7  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  36.23 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  40.52 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  32.92 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  56 
 
 		 120 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  44.57 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  55.74 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  61.22 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  30.81 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  24.24 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  60 
 
 		 54 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  48.72 
 
 		 86 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  48.72 
 
 		 86 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  62.16 
 
 		 51 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  72.41 
 
 		 70 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  31.52 
 
 		 383 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  51.02 
 
 		 68 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  51.28 
 
 		 359 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>