41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2786 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  68.46 
 
 		 341 aa  203  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  65.03 
 
 		 156 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  65.03 
 
 		 156 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  65.1 
 
 		 341 aa  200  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  67.11 
 
 		 341 aa  200  9e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  60.48 
 
 		 350 aa  160  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  34.09 
 
 		 364 aa  90.9  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  40.5 
 
 		 395 aa  87.8  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  38.84 
 
 		 368 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  39.84 
 
 		 368 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  38.84 
 
 		 368 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  36.23 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  38.02 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  36.92 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  37.19 
 
 		 368 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  37.7 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  36.36 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  38.02 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  38.52 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  36.89 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  34.45 
 
 		 357 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  34.92 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  33.61 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  36.07 
 
 		 355 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  34.43 
 
 		 355 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  35.25 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  36.21 
 
 		 347 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  36.9 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  35.63 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  38.96 
 
 		 299 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  32.43 
 
 		 355 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  33.02 
 
 		 133 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  32.43 
 
 		 355 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  28.77 
 
 		 355 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  35.82 
 
 		 120 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  27.66 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  27.73 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  28.32 
 
 		 362 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>