More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1301 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  100 
 
 
231 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  78.95 
 
 
267 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  78.95 
 
 
267 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  78.95 
 
 
271 aa  388  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  73.54 
 
 
284 aa  352  4e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  78.54 
 
 
209 aa  350  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  78.54 
 
 
209 aa  350  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  69.74 
 
 
283 aa  346  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  71.89 
 
 
282 aa  336  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  66.09 
 
 
289 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  66.09 
 
 
289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  66.09 
 
 
289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  66.09 
 
 
289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  66.09 
 
 
289 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  66.23 
 
 
265 aa  334  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  70.83 
 
 
286 aa  329  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  65.91 
 
 
240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  65.91 
 
 
240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  65.91 
 
 
240 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  66.06 
 
 
276 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  63.71 
 
 
309 aa  317  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  63.01 
 
 
278 aa  305  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  62.56 
 
 
250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  62.1 
 
 
278 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  62.56 
 
 
278 aa  294  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  61.36 
 
 
251 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  58.11 
 
 
250 aa  280  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  62.66 
 
 
174 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  62.66 
 
 
174 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  76.64 
 
 
195 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  76.64 
 
 
195 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  62.75 
 
 
153 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  48.62 
 
 
250 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  47.25 
 
 
273 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
345 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  48.17 
 
 
358 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  51.6 
 
 
279 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  51.6 
 
 
279 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  51.6 
 
 
279 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  58.97 
 
 
225 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  44.84 
 
 
284 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  44.84 
 
 
284 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  44.84 
 
 
284 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  44.84 
 
 
285 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  44.84 
 
 
284 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  44.84 
 
 
285 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  50.23 
 
 
279 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  50.23 
 
 
279 aa  194  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  43.35 
 
 
280 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  49.54 
 
 
227 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  46.64 
 
 
284 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  47.98 
 
 
273 aa  191  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  47.98 
 
 
273 aa  191  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  47.98 
 
 
273 aa  191  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  44.65 
 
 
282 aa  191  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  44.65 
 
 
282 aa  191  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  45.62 
 
 
263 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  46.19 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  46.19 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  45.87 
 
 
260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
276 aa  188  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
276 aa  188  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
276 aa  188  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
276 aa  187  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  44.4 
 
 
279 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  44.4 
 
 
279 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  44.4 
 
 
279 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  44.4 
 
 
279 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  44.4 
 
 
279 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  42.04 
 
 
275 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  42.04 
 
 
275 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  42.04 
 
 
275 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  42.04 
 
 
275 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>