More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4908 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  86.88 
 
 		 282 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  81.98 
 
 		 286 aa  471  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  71.97 
 
 		 284 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  66.43 
 
 		 289 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  67.05 
 
 		 271 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  67.05 
 
 		 267 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  67.05 
 
 		 267 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  62.33 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  63.2 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  68.75 
 
 		 265 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  69.74 
 
 		 231 aa  346  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  69.74 
 
 		 231 aa  346  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  69.74 
 
 		 231 aa  346  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  69.74 
 
 		 231 aa  346  3e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  68 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  68 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  68 
 
 		 240 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  59.64 
 
 		 278 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  59.93 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  61.72 
 
 		 278 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  60 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  67.63 
 
 		 209 aa  308  5e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  67.63 
 
 		 209 aa  308  5e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  63.79 
 
 		 251 aa  298  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  58.2 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  71.76 
 
 		 195 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  71.76 
 
 		 195 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  63.33 
 
 		 225 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  64.15 
 
 		 174 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  64.15 
 
 		 174 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  63.4 
 
 		 153 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  45.31 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  45.56 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  45.7 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  45.24 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  46.43 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  46.43 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  43.97 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  38.74 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  38.74 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  38.74 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  38.74 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  45.14 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  41.04 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  39.15 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  39.15 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  42.86 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  43.25 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  43.25 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  43.25 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  41.64 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  41.64 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  40.94 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  41.64 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  41.64 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  43.43 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  43.43 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  43.43 
 
 		 267 aa  188  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  44.76 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  44.76 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  44.76 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  44.76 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  44.76 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  43.7 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  43.7 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  43.7 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  43.7 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  43.7 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  41.11 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  47.42 
 
 		 250 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>