More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1082 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  99.65 
 
 
289 aa  586  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  83.77 
 
 
265 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  67.47 
 
 
284 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 
283 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  72 
 
 
282 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  71.31 
 
 
286 aa  381  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  61.26 
 
 
309 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  62.69 
 
 
271 aa  364  1e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  62.69 
 
 
267 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  62.69 
 
 
267 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  59.34 
 
 
276 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  66.09 
 
 
231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  66.09 
 
 
231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  66.09 
 
 
231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  66.09 
 
 
231 aa  336  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  60.39 
 
 
278 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  63.48 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  63.48 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  63.48 
 
 
240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  58.05 
 
 
278 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  58.82 
 
 
278 aa  321  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  59.32 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  63.11 
 
 
209 aa  298  6e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  63.11 
 
 
209 aa  298  6e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  79.67 
 
 
225 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  55.82 
 
 
251 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  53.47 
 
 
250 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  77.65 
 
 
195 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  77.65 
 
 
195 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  63.41 
 
 
174 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  63.41 
 
 
174 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0120  hypothetical protein  85.95 
 
 
205 aa  221  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  45.24 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  60.13 
 
 
153 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  45.63 
 
 
358 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  44.84 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  44.84 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  44.84 
 
 
279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  46.67 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  41.2 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  44.84 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  44.84 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  41.2 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  41.2 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  41.2 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
260 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  44.27 
 
 
260 aa  192  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  41.04 
 
 
285 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  41.04 
 
 
285 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  43.48 
 
 
284 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  43.53 
 
 
279 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  43.53 
 
 
279 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  43.53 
 
 
279 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  43.53 
 
 
279 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  43.53 
 
 
279 aa  188  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  41.34 
 
 
263 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  43.08 
 
 
284 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  43.08 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  42.46 
 
 
273 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  42.46 
 
 
273 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  42.46 
 
 
273 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  44.69 
 
 
250 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  41.67 
 
 
274 aa  186  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  37.37 
 
 
307 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  42.63 
 
 
267 aa  185  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  42.63 
 
 
267 aa  185  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  42.63 
 
 
267 aa  185  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  39.1 
 
 
305 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  39.1 
 
 
305 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  40 
 
 
309 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  39.84 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  39.84 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>