More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2522 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  100 
 
 
153 aa  323  7e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  96.08 
 
 
276 aa  312  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  75 
 
 
240 aa  253  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  75 
 
 
240 aa  253  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  75 
 
 
240 aa  253  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  74.17 
 
 
174 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  74.17 
 
 
174 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  64.05 
 
 
282 aa  221  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  61.84 
 
 
284 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  63.4 
 
 
283 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  64.71 
 
 
250 aa  215  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  64.71 
 
 
278 aa  215  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  64.47 
 
 
278 aa  213  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  62.09 
 
 
286 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  63.4 
 
 
250 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  64.47 
 
 
278 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  59.48 
 
 
271 aa  210  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  59.48 
 
 
267 aa  210  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  59.48 
 
 
267 aa  210  7e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  62.75 
 
 
251 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  62.75 
 
 
231 aa  209  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  62.75 
 
 
231 aa  209  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  62.75 
 
 
231 aa  209  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  62.75 
 
 
231 aa  209  9e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  59.48 
 
 
209 aa  208  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  59.48 
 
 
209 aa  208  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  60.78 
 
 
309 aa  207  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  60.13 
 
 
289 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  60.13 
 
 
289 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  60.13 
 
 
289 aa  207  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  60.13 
 
 
289 aa  207  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  60.13 
 
 
289 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  58.17 
 
 
265 aa  201  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  57.24 
 
 
227 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 
279 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 
279 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  53.42 
 
 
273 aa  168  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  53.42 
 
 
273 aa  168  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  53.42 
 
 
273 aa  168  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  55.56 
 
 
279 aa  167  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  55.56 
 
 
279 aa  167  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  54.86 
 
 
279 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
250 aa  156  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
345 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  49.01 
 
 
358 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  48.34 
 
 
273 aa  153  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  46.45 
 
 
283 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  46.45 
 
 
284 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  44.81 
 
 
284 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  44.81 
 
 
284 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  44.81 
 
 
284 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  44.81 
 
 
285 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  44.81 
 
 
285 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  44.81 
 
 
284 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  51.13 
 
 
162 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  45.03 
 
 
269 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  45.03 
 
 
269 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  45.03 
 
 
269 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  45.03 
 
 
269 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  44.59 
 
 
274 aa  135  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  44.52 
 
 
189 aa  134  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  44.74 
 
 
297 aa  134  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  42.95 
 
 
307 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  41.61 
 
 
260 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  42.28 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  42.28 
 
 
269 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  44.52 
 
 
272 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  44.52 
 
 
272 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  44.52 
 
 
272 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  44.52 
 
 
272 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  44.52 
 
 
272 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  71.79 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4081  integrase catalytic region  39.33 
 
 
210 aa  126  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  41.22 
 
 
290 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  44.08 
 
 
284 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1829  hypothetical protein  70.51 
 
 
274 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>