More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3531 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  91.73 
 
 
278 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  91.37 
 
 
278 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  96.8 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  90.04 
 
 
251 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  86.4 
 
 
250 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  69.23 
 
 
276 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  69.17 
 
 
240 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  69.17 
 
 
240 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  69.17 
 
 
240 aa  358  6e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  58.82 
 
 
284 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  59.64 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  57.75 
 
 
271 aa  332  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  64.11 
 
 
282 aa  332  5e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  60.39 
 
 
289 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  60.39 
 
 
289 aa  331  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  57.75 
 
 
267 aa  332  6e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  60.39 
 
 
289 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  60.39 
 
 
289 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  60.39 
 
 
289 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  57.75 
 
 
267 aa  332  6e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  61.42 
 
 
286 aa  324  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  63.01 
 
 
231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  63.01 
 
 
231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  63.01 
 
 
231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  63.01 
 
 
231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  54.71 
 
 
309 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  55.24 
 
 
265 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  58.5 
 
 
209 aa  266  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  58.5 
 
 
209 aa  266  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  66.09 
 
 
174 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  66.09 
 
 
174 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  59.32 
 
 
195 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  59.32 
 
 
195 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  64.71 
 
 
153 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  39.93 
 
 
273 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  91.82 
 
 
111 aa  208  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  41.73 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  41.73 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  41.73 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  41.73 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  39.19 
 
 
358 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  43.75 
 
 
263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  42.86 
 
 
284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  42.47 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  42.47 
 
 
283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  41.57 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  41.57 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  53.11 
 
 
225 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  39.36 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  39.36 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  39.36 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  39.36 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
279 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  42.75 
 
 
279 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  42.35 
 
 
279 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  39.45 
 
 
282 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  39.45 
 
 
282 aa  186  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  37.69 
 
 
277 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1654  IS407A, transposase OrfB  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1688  IS1404 transposase  37.69 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.722668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>