More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1111 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  100 
 
 
273 aa  556  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
358 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  96.32 
 
 
345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  96 
 
 
250 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  69.14 
 
 
297 aa  353  1e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  95.42 
 
 
162 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  93.75 
 
 
148 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  50.75 
 
 
263 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  47.15 
 
 
284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  45.72 
 
 
280 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  45.04 
 
 
267 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  45.04 
 
 
267 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  45.04 
 
 
271 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  49.42 
 
 
267 aa  228  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  49.42 
 
 
267 aa  228  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  49.42 
 
 
267 aa  228  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  45.35 
 
 
279 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  43.75 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  45.05 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  45.24 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  45.24 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  45.24 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  43.01 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  45.24 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  45.24 
 
 
289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  44.16 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  43.01 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  45.63 
 
 
269 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  39.93 
 
 
278 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0312  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0097322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0783  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1719  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0006  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0291  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0238689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0366  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0269645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0377  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0464  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0491  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1524  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1610  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1629  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00878015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  44.19 
 
 
277 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>