More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4903 on replicon NC_013442
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  100 
 
 
277 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4711  Integrase catalytic region  95.31 
 
 
277 aa  559  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0897  Integrase catalytic region  97.42 
 
 
442 aa  474  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.157158  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5439  integrase catalytic subunit  72.66 
 
 
278 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  71.16 
 
 
271 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  58.4 
 
 
263 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  56.81 
 
 
267 aa  286  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  56.81 
 
 
267 aa  286  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  56.81 
 
 
267 aa  286  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  44.16 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
345 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  43.96 
 
 
358 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  41.38 
 
 
260 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  41.13 
 
 
307 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  40.75 
 
 
309 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  44.12 
 
 
250 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  41.47 
 
 
284 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  41.86 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  39 
 
 
274 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  39.85 
 
 
276 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  39.3 
 
 
290 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  39.3 
 
 
290 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 
393 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  40.78 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  41.79 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  37.69 
 
 
372 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  37.74 
 
 
280 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  35.93 
 
 
276 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  38.52 
 
 
290 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  38.52 
 
 
290 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  40 
 
 
289 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  40 
 
 
289 aa  168  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  40 
 
 
289 aa  168  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  40 
 
 
289 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  40 
 
 
289 aa  168  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  37.6 
 
 
267 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  37.6 
 
 
267 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  37.6 
 
 
271 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  38.93 
 
 
309 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  38.26 
 
 
280 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  39.23 
 
 
286 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  38.93 
 
 
309 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  38.93 
 
 
309 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  35.56 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  35.56 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  35.56 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  37.35 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  38.93 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  36.43 
 
 
273 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  36.43 
 
 
273 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  36.43 
 
 
273 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  36.43 
 
 
273 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  36.43 
 
 
273 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  40.86 
 
 
290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  37.97 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  38.24 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>